Basic Information

Symbol
PTGFRN
RNA class
mRNA
Alias
Prostaglandin F2 Receptor Inhibitor CD9P-1 EWI-F FPRP Prostaglandin F2 Receptor Negative Regulator KIAA1436 SMAP-6 CD315 Prostaglandin F2-Alpha Receptor Regulatory Protein Prostaglandin F2-Alpha Receptor-Associated Protein Glu-Trp-Ile EWI Motif-Containing Protein F CD9 Partner 1 FLJ11001 CD315 Antigen CD9P1 EWIF
Location (GRCh38)
1:116909894-116990358
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020440.4
Sequence length
6314.0 nt
GC content
0.5220

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2251.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2365.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2105.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_020440.4 NCBI
CCCUUCUGCUUUCGGGAAGCGGUCGGGGCUGCACACUCGGAUCGGCGGG… 6314 nt 0.5220
Summary

Predicted to be involved in myoblast fusion involved in skeletal muscle regeneration. Predicted to act upstream of or within lipid droplet organization. Located in cell surface. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human cardiac tissue demonstrated that the PTGFRN mRNA was upregulated at least threefold in cases of mechanical asphyxia compared to craniocerebral injury, hemorrhagic shock, and other causes of death, identifying it as a potential biomarker for mechanical asphyxia-induced death [Zeng et al. DOI:10.1007/S00414-017-1616-4].