Basic Information

Symbol
PTGIR
RNA class
mRNA
Alias
Prostaglandin I2 Receptor Prostacyclin Receptor IP Prostaglandin I2 (Prostacyclin) Receptor (IP) Prostanoid IP Receptor PGI2 Receptor PGI Receptor PRIPR
Location (GRCh38)
19:46618550-46625534
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000960.4
Sequence length
2078.0 nt
GC content
0.6415

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-936.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -968.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 368.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000960.4 NCBI
ACACAGACCGACACAGGCAGCGAGAGACACGAGGAGCAAAGCAAGUGAA… 2078 nt 0.6415
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the G-protein coupled receptor family 1 and has been shown to be a receptor for prostacyclin. Prostacyclin, the major product of cyclooxygenase in macrovascular endothelium, elicits a potent vasodilation and inhibition of platelet aggregation through binding to this receptor. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A single-cell transcriptomic analysis in a rat model of radiation-induced lung injury identified the PTGIR as an orthologous rat gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].