Basic Information

Symbol
PTK2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Tyrosine Kinase 2 PPP1R71 FAK1 FAK FADK Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 71 Focal Adhesion Kinase-Related Nonkinase PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2 Focal Adhesion Kinase 1 EC 2.7.10.2 Pp125FAK P125FAK FADK 1 FRNK Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 71 FAK-Related Non-Kinase Polypeptide Protein-Tyrosine Kinase 2 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352702.2
Sequence length
5136.0 nt
GC content
0.4511

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1586.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199649.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5043 nt 0.4507
NM_001316342.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4796 nt 0.4466
NM_001352694.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4915 nt 0.4496
NM_001352695.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5043 nt 0.4503
NM_001352696.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4885 nt 0.4479
NM_001352697.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5461 nt 0.4527
NM_001352698.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5361 nt 0.4557
NM_001352699.2 NCBI
CACACCGCGGAAGCCCGGGUCGGUGUCGGGGCGAGCCUUCCCUCCUUUU… 5044 nt 0.4435
NM_001352700.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5047 nt 0.4500
NM_001352701.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5235 nt 0.4495
Showing 1 to 10 of 130 entries
Summary

This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.