Basic Information

Symbol
PTK2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Tyrosine Kinase 2 PPP1R71 FAK1 FAK FADK Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 71 Focal Adhesion Kinase-Related Nonkinase PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2 Focal Adhesion Kinase 1 EC 2.7.10.2 Pp125FAK P125FAK FADK 1 FRNK Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 71 FAK-Related Non-Kinase Polypeptide Protein-Tyrosine Kinase 2 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352702.2
Sequence length
5136.0 nt
GC content
0.4511

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1586.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..)))).....(((((((((.....(((((((((((.(((((((((.(((.(((.(((((((.((((.....)))))))))......))..))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((...........((((.((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.((.........)))).))))...((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).))......)))).....))))))))))))))))...((((((.((...((((((...(((........)))...((((((((((.....(((((((((((((((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).....((((((..(((....)))....(((((((((.......(((((((..(((....)))))).))))........)))))))))((((......))))((((..((((((....)))))).))))))))))((......)).))))))))).....(((........))))))......))).)))))))...))))))..)).))))))......((.(((((......((((.((...(((..(((((((.(((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.(((((((.((((.((((....((.(((((((....(((((((.((((((((.(((.......)))((.(((.(((..(((((((((((..((..((((((((....((((((((((.............)))).....((.....)).((((..(((......))).)))).(((((..(.(((.....))).)..)))))........))))))...))))))))..))..)))))..(((((((((..((.(((......))).)).....))))))))).....)))))).)))))).)).......(((((......))).))((((((.........)).))))......((((.((((((..((((((((((.........)))).....(((((((((((((((...(((((...((((.((((((........))))))......((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))))))..)))))..))))))))).)))))).....)))))).(((((.(((......)))..))))).......((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....((..((((((.((.(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..))))))))..))..........((((((.(((.(...((((.(((((((((((.((((((.....(((..((.(((.(((..((.((.((((((((.((...........((((((..((..............))..))))))((((........)))))))))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).))).)).))..)))))).)).)))..(((.(((....))).))).(((((((......))))))).......)))))))))))).......))))).))))...).))).)))))).))))))))))(((((........))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...(((((.((((((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.((.(((((((((..((....(((.(......).)))....)))))))))))(((((.(((((((((((((...(((((((.((((((((((.....(((..((....))....)))....(((((...))))).((((((.......((((((..(((((.((((((((((....(((..(((.(((............))).)))...)))))))))).(((((((.....((.......))....)))))))(((((....)))))))).))).))(((.((((((....))))))..))).......((((......((.(((.(((....))))))))......)))).))))))))))))...((((((...((((.(((((.(.(.(((.((............)).)))..).))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.(((........))).)))))((((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((..(((.........)))((((.((((((((((((...((((.....((((((......))))))...))))....))))))...(((((.....)))))....(((..(((((((.(((.........(((......))).......(((....)))))))))))))...)))))))))))))..............((((.(((......(((((((..........))))))))))..)))).))))).)).))).......((((.(((((((..............))))))).))))..((((.(.......).))))..........))))))))))..))))........))))...))))))))...........((((((((....(((........)))))))))))....)))))))...))))))))))))))))))((((((..............)))))))))))).)))))..))))).)))))))..((((((....(((.((((..(((....)))........(((((.....))))))))))))....))))))((((((((((((...((((((.........))))))...........((((((..(((((...(((.((((((..((((((((((((((.............))).)))))))))..((((...))))...........(((((((.....(((((....)))))...)))))))))..))))))..)))...)))))..((((((((.....))))))))((((((.((((((.............(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...)))))))............)))))).))))))...((((......)))).........))))))..((..(((((((((.((.((((...(((((((...)))))))........)))).)).)))))))))..))...))))))))))))((..((((((((.....))))))))..)).....))))))))).))))))).......)))).))...)))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((......(((.....)))....))))....)))))))...................))))...))))..)))))))((((.....))))...((((....(((((((((((.(((.((.((....((((.......)))))).))..))).)))))..))))))...))))......)))).))))).))))))).)))))....)))))))))).(((.((((.(((......(((((((((............))))..)))))........))))))).)))........(((((............)))))((((((.......))))))))))))).......)))))))..))).)).))))......))))).))((.((((..(((((.........((((......))))..))))))))).)).))).)))))...)))).......)))))...(((((.(((.(((((...((((((((.....((..((((...(((...(((((...)))))...(((((((...)))))))...((((.........(((((.((((........))))))))).))))...))).))))..))....)))))))).))))).)))..)))))......(((....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..))))..{({((({,((((.....(((((((((((.(((((((((.(((,(({.({(((((.((((.....)))))))))...,..,,,.))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((..,..,,{{..{,(({(((({{,,((({{{.,,,.,,|,,..,,,...,))),))},))),.)).}|||,,,{{(((.,{,{|{{......{{{|.{{{|,,...((.({{((({(((({{{,,,....{{{....{,((({{{.{{,,,,..||,}}}||||||.}||,......|{({(({|,..,|{,.|,,,{,,,...,{,{(((((......))))))}}})),)}.}}}}..},||{||}|||,|,,..||||},.((((((((({.(((....))).}))))).)))}{{{.,,,((((.{{((((((..,,...,,.))))))}))))))...}))(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}})..)))){(((((((((((((...})))))},)))).))}...{,....,,...)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......{{{,....)}))))})},,,))},))))),..,})},,},)})))))),.))).}}.....,))),.,,,.))))))))))))))))...((((((.((...((((((...((,...,,,..}}}...((((((((((.,,..((({,(((({((({{((.((,{{{(((((({{.((..((,{......||..|,....,||,,,,..},,,.})))).....{((((,..(({....}}},,,.,((((({((,,,,{{{(((({((,.(((,...,}}}},,)))}.},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..},.}}})))))),}}..|||...,},.,))})))..,,..))).)))))))...))))))..)).))))))......{(.(((((.,,...((((.((...(((..(((((((.{((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.{(({{{{.,,{{.{(((..,{((.(((((((....(((((((.(((((((((((.(,,(((((((((((.,.......,,,,,,((((((........((({...((((..((({{{{{...,|...{{||{{{....((.....))..}}}..||{.((((((((({{(((((((...,((.(({(((({{{{..,{,,,,.,...(((((((.....))))))),,||,{((,(((((((((((((..((.(((......))).)).....)))))))),...,,,|,|||{..,{{{,|,,,,,,,,{{,,{,,,,,.}}}...((((((.........)).))))...,...}}}}|||||}.,((({{{.(((.....}},.,.)),}..}||||{{(((((((((...(((((...{(((((((,{(...,,...||}|||..,{{.((((.(((....(((.{({.((((((........))).))).})}.)))..})).))))..},}||||||....},)))))))}..)))))..))))))))).|}||,|,.,,.}}}}}},}))},,)}))))}}}}.)).,)))))))}...((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).)){{,...{((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))}..||,,,.,,||||,||.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..,,,))))},{{((({|{({.{{{.....))).))}.})))))},)))))))))..||((((((((.,((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...)))))),.})},......)))),,))).)).,...)))}}))))||(((({....(((((((.((...((((((((((....((((....)).))|(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},)))))))))))))),)))))..}}}..))}}..})}...,.(((.(((....))).))).))))))..))),,)).)))))))))))))...(((.((((((.....(((......((((((,........},)))))).....))).......)))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...{(({{,(({(((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.(((((.(({((((,...}))))}}))),{{{({{{{{{{{{||||,..,,,|||{{.(((((((((((((...(((((({.((((((((((....,(((..,,.,,|}}....,,,....{((({...)))),.(((((((.....,(((,((.(((,,(.((.(((((((....(((..{((.{{{............})},)}}...)))))))))).))))}}},,...,........,|,,,,|||,|{((((((....)))))}|}||{{{..(((.((((((....))))))..)))....,|,||{|,.....((.{((.(((....))))))))......,)))})))),)))))))...((((((...(((,,(((({,(.{.(((.((...,,.....,,)).)))..,.))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.{((.......,))).))))){{((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((.,({{.........,||(,{.(((((((((((((...((((.{{..((((((......)))))).}}))))....))))))...(((((.....)))))..,,(((..(((((({.(((,.,,...{{{{,..,,..}}},......,||...,)))))))))))))...))))))))))})),.............{((,.{(((..{{.(((((((..........))))))).))))))}).))))).)).)))....{{,((((.(((((((.............,))))))).))))}},,{{,{.......}.}}))..........))))))))))..))))},......,))).,.}))}}}}},..........{(((((((....{{{........})))))))))}....,))))))...)))))))))))))}}))}||||||.,},,.}},..,,,}},,,.)))))).)))))..))))).)))))))..((((((....{({.((({..(((....)))..,,,,..(((((.....)))))})))}}}....)))))){(((((((((((...((((((,........}}}}}}...{{,{....((((({.,|{{{,,{,{{{.((((({..((((((((((((((.....,,....||}||.}}||})}},,|{{{,..,,))},.......,,.,,|||||}},,,|{|{|....))}))...}},,}}}}}..})))))..)))...,,,,,..((((((((.....))))))))((((((.((((((.{(,..,......(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...))))))).........}),)))))).))))))...((({......))))..}}},...)))))}..((..(((((((((.((.((((,..(((((((...)))))))..}.....)))).)).)))))))))..))...)))))))))))){{..((((((((.....))))))))..}}.....))))))))).))))))).......)))).)}...}))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((...,..{{{.....}))....))))....)))))))...,||.......,,,,.,||||,..,,,,..)}}))))|,||,....}}}},,,(((({{,,((((({(((((.(((.{{,((,...((({.......))))},.}}..))).)))))..)))))}.,.}}))},,,..)))).))))).))))))).))))}....)))))))))}.,{{.,(((,,,.......(((((((((..,,....,,..))))..))))).,,....})}.,}},.....,,,,,,.||||,.,..,.,,},.,}}}}|((((((.{....}))))))))))))).......)))))))..))).)).))))...,,.))))).)}((.((((..(((((.......{,(({{....,.}}),.}))))))))).)).))).)))))...})}}......}))}}....,{{{,{((({((({{,,..((((({,,....})))))).,|||{{.{{(({{{.(((((.....(((((((...))))))).....))))}......(((((.(({(,.......))))))))),||{{..,})),)}}.},}))))})))}..,,.,,}}}......,|||,.....}|||....}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001387624.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4437 nt 0.4546
NM_001387625.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4448 nt 0.4546
NM_001387627.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4457 nt 0.4541
NM_001387628.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4471 nt 0.4545
NM_001387629.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4474 nt 0.4571
NM_001387630.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4487 nt 0.4533
NM_001387631.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4495 nt 0.4552
NM_001387632.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4497 nt 0.4547
NM_001387633.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4527 nt 0.4546
NM_001387634.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4529 nt 0.4555
Showing 91 to 100 of 130 entries
Summary

This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.