Basic Information

Symbol
PTK2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Tyrosine Kinase 2 PPP1R71 FAK1 FAK FADK Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 71 Focal Adhesion Kinase-Related Nonkinase PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2 Focal Adhesion Kinase 1 EC 2.7.10.2 Pp125FAK P125FAK FADK 1 FRNK Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 71 FAK-Related Non-Kinase Polypeptide Protein-Tyrosine Kinase 2 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352702.2
Sequence length
5136.0 nt
GC content
0.4511

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1586.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..)))).....(((((((((.....(((((((((((.(((((((((.(((.(((.(((((((.((((.....)))))))))......))..))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((...........((((.((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.((.........)))).))))...((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).))......)))).....))))))))))))))))...((((((.((...((((((...(((........)))...((((((((((.....(((((((((((((((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).....((((((..(((....)))....(((((((((.......(((((((..(((....)))))).))))........)))))))))((((......))))((((..((((((....)))))).))))))))))((......)).))))))))).....(((........))))))......))).)))))))...))))))..)).))))))......((.(((((......((((.((...(((..(((((((.(((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.(((((((.((((.((((....((.(((((((....(((((((.((((((((.(((.......)))((.(((.(((..(((((((((((..((..((((((((....((((((((((.............)))).....((.....)).((((..(((......))).)))).(((((..(.(((.....))).)..)))))........))))))...))))))))..))..)))))..(((((((((..((.(((......))).)).....))))))))).....)))))).)))))).)).......(((((......))).))((((((.........)).))))......((((.((((((..((((((((((.........)))).....(((((((((((((((...(((((...((((.((((((........))))))......((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))))))..)))))..))))))))).)))))).....)))))).(((((.(((......)))..))))).......((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....((..((((((.((.(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..))))))))..))..........((((((.(((.(...((((.(((((((((((.((((((.....(((..((.(((.(((..((.((.((((((((.((...........((((((..((..............))..))))))((((........)))))))))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).))).)).))..)))))).)).)))..(((.(((....))).))).(((((((......))))))).......)))))))))))).......))))).))))...).))).)))))).))))))))))(((((........))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...(((((.((((((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.((.(((((((((..((....(((.(......).)))....)))))))))))(((((.(((((((((((((...(((((((.((((((((((.....(((..((....))....)))....(((((...))))).((((((.......((((((..(((((.((((((((((....(((..(((.(((............))).)))...)))))))))).(((((((.....((.......))....)))))))(((((....)))))))).))).))(((.((((((....))))))..))).......((((......((.(((.(((....))))))))......)))).))))))))))))...((((((...((((.(((((.(.(.(((.((............)).)))..).))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.(((........))).)))))((((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((..(((.........)))((((.((((((((((((...((((.....((((((......))))))...))))....))))))...(((((.....)))))....(((..(((((((.(((.........(((......))).......(((....)))))))))))))...)))))))))))))..............((((.(((......(((((((..........))))))))))..)))).))))).)).))).......((((.(((((((..............))))))).))))..((((.(.......).))))..........))))))))))..))))........))))...))))))))...........((((((((....(((........)))))))))))....)))))))...))))))))))))))))))((((((..............)))))))))))).)))))..))))).)))))))..((((((....(((.((((..(((....)))........(((((.....))))))))))))....))))))((((((((((((...((((((.........))))))...........((((((..(((((...(((.((((((..((((((((((((((.............))).)))))))))..((((...))))...........(((((((.....(((((....)))))...)))))))))..))))))..)))...)))))..((((((((.....))))))))((((((.((((((.............(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...)))))))............)))))).))))))...((((......)))).........))))))..((..(((((((((.((.((((...(((((((...)))))))........)))).)).)))))))))..))...))))))))))))((..((((((((.....))))))))..)).....))))))))).))))))).......)))).))...)))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((......(((.....)))....))))....)))))))...................))))...))))..)))))))((((.....))))...((((....(((((((((((.(((.((.((....((((.......)))))).))..))).)))))..))))))...))))......)))).))))).))))))).)))))....)))))))))).(((.((((.(((......(((((((((............))))..)))))........))))))).)))........(((((............)))))((((((.......))))))))))))).......)))))))..))).)).))))......))))).))((.((((..(((((.........((((......))))..))))))))).)).))).)))))...)))).......)))))...(((((.(((.(((((...((((((((.....((..((((...(((...(((((...)))))...(((((((...)))))))...((((.........(((((.((((........))))))))).))))...))).))))..))....)))))))).))))).)))..)))))......(((....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..))))..{({((({,((((.....(((((((((((.(((((((((.(((,(({.({(((((.((((.....)))))))))...,..,,,.))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((..,..,,{{..{,(({(((({{,,((({{{.,,,.,,|,,..,,,...,))),))},))),.)).}|||,,,{{(((.,{,{|{{......{{{|.{{{|,,...((.({{((({(((({{{,,,....{{{....{,((({{{.{{,,,,..||,}}}||||||.}||,......|{({(({|,..,|{,.|,,,{,,,...,{,{(((((......))))))}}})),)}.}}}}..},||{||}|||,|,,..||||},.((((((((({.(((....))).}))))).)))}{{{.,,,((((.{{((((((..,,...,,.))))))}))))))...}))(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}})..)))){(((((((((((((...})))))},)))).))}...{,....,,...)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......{{{,....)}))))})},,,))},))))),..,})},,},)})))))),.))).}}.....,))),.,,,.))))))))))))))))...((((((.((...((((((...((,...,,,..}}}...((((((((((.,,..((({,(((({((({{((.((,{{{(((((({{.((..((,{......||..|,....,||,,,,..},,,.})))).....{((((,..(({....}}},,,.,((((({((,,,,{{{(((({((,.(((,...,}}}},,)))}.},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..},.}}})))))),}}..|||...,},.,))})))..,,..))).)))))))...))))))..)).))))))......{(.(((((.,,...((((.((...(((..(((((((.{((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.{(({{{{.,,{{.{(((..,{((.(((((((....(((((((.(((((((((((.(,,(((((((((((.,.......,,,,,,((((((........((({...((((..((({{{{{...,|...{{||{{{....((.....))..}}}..||{.((((((((({{(((((((...,((.(({(((({{{{..,{,,,,.,...(((((((.....))))))),,||,{((,(((((((((((((..((.(((......))).)).....)))))))),...,,,|,|||{..,{{{,|,,,,,,,,{{,,{,,,,,.}}}...((((((.........)).))))...,...}}}}|||||}.,((({{{.(((.....}},.,.)),}..}||||{{(((((((((...(((((...{(((((((,{(...,,...||}|||..,{{.((((.(((....(((.{({.((((((........))).))).})}.)))..})).))))..},}||||||....},)))))))}..)))))..))))))))).|}||,|,.,,.}}}}}},}))},,)}))))}}}}.)).,)))))))}...((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).)){{,...{((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))}..||,,,.,,||||,||.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..,,,))))},{{((({|{({.{{{.....))).))}.})))))},)))))))))..||((((((((.,((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...)))))),.})},......)))),,))).)).,...)))}}))))||(((({....(((((((.((...((((((((((....((((....)).))|(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},)))))))))))))),)))))..}}}..))}}..})}...,.(((.(((....))).))).))))))..))),,)).)))))))))))))...(((.((((((.....(((......((((((,........},)))))).....))).......)))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...{(({{,(({(((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.(((((.(({((((,...}))))}}))),{{{({{{{{{{{{||||,..,,,|||{{.(((((((((((((...(((((({.((((((((((....,(((..,,.,,|}}....,,,....{((({...)))),.(((((((.....,(((,((.(((,,(.((.(((((((....(((..{((.{{{............})},)}}...)))))))))).))))}}},,...,........,|,,,,|||,|{((((((....)))))}|}||{{{..(((.((((((....))))))..)))....,|,||{|,.....((.{((.(((....))))))))......,)))})))),)))))))...((((((...(((,,(((({,(.{.(((.((...,,.....,,)).)))..,.))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.{((.......,))).))))){{((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((.,({{.........,||(,{.(((((((((((((...((((.{{..((((((......)))))).}}))))....))))))...(((((.....)))))..,,(((..(((((({.(((,.,,...{{{{,..,,..}}},......,||...,)))))))))))))...))))))))))})),.............{((,.{(((..{{.(((((((..........))))))).))))))}).))))).)).)))....{{,((((.(((((((.............,))))))).))))}},,{{,{.......}.}}))..........))))))))))..))))},......,))).,.}))}}}}},..........{(((((((....{{{........})))))))))}....,))))))...)))))))))))))}}))}||||||.,},,.}},..,,,}},,,.)))))).)))))..))))).)))))))..((((((....{({.((({..(((....)))..,,,,..(((((.....)))))})))}}}....)))))){(((((((((((...((((((,........}}}}}}...{{,{....((((({.,|{{{,,{,{{{.((((({..((((((((((((((.....,,....||}||.}}||})}},,|{{{,..,,))},.......,,.,,|||||}},,,|{|{|....))}))...}},,}}}}}..})))))..)))...,,,,,..((((((((.....))))))))((((((.((((((.{(,..,......(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...))))))).........}),)))))).))))))...((({......))))..}}},...)))))}..((..(((((((((.((.((((,..(((((((...)))))))..}.....)))).)).)))))))))..))...)))))))))))){{..((((((((.....))))))))..}}.....))))))))).))))))).......)))).)}...}))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((...,..{{{.....}))....))))....)))))))...,||.......,,,,.,||||,..,,,,..)}}))))|,||,....}}}},,,(((({{,,((((({(((((.(((.{{,((,...((({.......))))},.}}..))).)))))..)))))}.,.}}))},,,..)))).))))).))))))).))))}....)))))))))}.,{{.,(((,,,.......(((((((((..,,....,,..))))..))))).,,....})}.,}},.....,,,,,,.||||,.,..,.,,},.,}}}}|((((((.{....}))))))))))))).......)))))))..))).)).))))...,,.))))).)}((.((((..(((((.......{,(({{....,.}}),.}))))))))).)).))).)))))...})}}......}))}}....,{{{,{((({((({{,,..((((({,,....})))))).,|||{{.{{(({{{.(((((.....(((((((...))))))).....))))}......(((((.(({(,.......))))))))),||{{..,})),)}}.},}))))})))}..,,.,,}}}......,|||,.....}|||....}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001387645.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4874 nt 0.4616
NM_001387646.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4879 nt 0.4558
NM_001387647.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4915 nt 0.4592
NM_001387648.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4920 nt 0.4535
NM_001387649.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4968 nt 0.4533
NM_001387650.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5135 nt 0.4610
NM_001387651.1 NCBI
AGUCCCGGGGCGGAUGCGGCGGAGACCGGCCCCUCCCGCGCCCCCGGCC… 2119 nt 0.4092
NM_001387652.1 NCBI
AGUCCCGGGGCGGAUGCGGCGGAGACCGGCCCCUCCCGCGCCCCCGGCC… 4213 nt 0.4474
NM_001387653.1 NCBI
AGUCCCGGGGCGGAUGCGGCGGAGACCGGCCCCUCCCGCGCCCCCGGCC… 4272 nt 0.4511
NM_001387654.1 NCBI
AGUCCCGGGGCGGAUGCGGCGGAGACCGGCCCCUCCCGCGCCCCCGGCC… 4302 nt 0.4489
Showing 111 to 120 of 130 entries
Summary

This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.