Basic Information

Symbol
PTK2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Tyrosine Kinase 2 PPP1R71 FAK1 FAK FADK Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 71 Focal Adhesion Kinase-Related Nonkinase PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2 Focal Adhesion Kinase 1 EC 2.7.10.2 Pp125FAK P125FAK FADK 1 FRNK Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 71 FAK-Related Non-Kinase Polypeptide Protein-Tyrosine Kinase 2 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352702.2
Sequence length
5136.0 nt
GC content
0.4511

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1586.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..)))).....(((((((((.....(((((((((((.(((((((((.(((.(((.(((((((.((((.....)))))))))......))..))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((...........((((.((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.((.........)))).))))...((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).))......)))).....))))))))))))))))...((((((.((...((((((...(((........)))...((((((((((.....(((((((((((((((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).....((((((..(((....)))....(((((((((.......(((((((..(((....)))))).))))........)))))))))((((......))))((((..((((((....)))))).))))))))))((......)).))))))))).....(((........))))))......))).)))))))...))))))..)).))))))......((.(((((......((((.((...(((..(((((((.(((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.(((((((.((((.((((....((.(((((((....(((((((.((((((((.(((.......)))((.(((.(((..(((((((((((..((..((((((((....((((((((((.............)))).....((.....)).((((..(((......))).)))).(((((..(.(((.....))).)..)))))........))))))...))))))))..))..)))))..(((((((((..((.(((......))).)).....))))))))).....)))))).)))))).)).......(((((......))).))((((((.........)).))))......((((.((((((..((((((((((.........)))).....(((((((((((((((...(((((...((((.((((((........))))))......((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))))))..)))))..))))))))).)))))).....)))))).(((((.(((......)))..))))).......((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....((..((((((.((.(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..))))))))..))..........((((((.(((.(...((((.(((((((((((.((((((.....(((..((.(((.(((..((.((.((((((((.((...........((((((..((..............))..))))))((((........)))))))))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).))).)).))..)))))).)).)))..(((.(((....))).))).(((((((......))))))).......)))))))))))).......))))).))))...).))).)))))).))))))))))(((((........))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...(((((.((((((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.((.(((((((((..((....(((.(......).)))....)))))))))))(((((.(((((((((((((...(((((((.((((((((((.....(((..((....))....)))....(((((...))))).((((((.......((((((..(((((.((((((((((....(((..(((.(((............))).)))...)))))))))).(((((((.....((.......))....)))))))(((((....)))))))).))).))(((.((((((....))))))..))).......((((......((.(((.(((....))))))))......)))).))))))))))))...((((((...((((.(((((.(.(.(((.((............)).)))..).))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.(((........))).)))))((((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((..(((.........)))((((.((((((((((((...((((.....((((((......))))))...))))....))))))...(((((.....)))))....(((..(((((((.(((.........(((......))).......(((....)))))))))))))...)))))))))))))..............((((.(((......(((((((..........))))))))))..)))).))))).)).))).......((((.(((((((..............))))))).))))..((((.(.......).))))..........))))))))))..))))........))))...))))))))...........((((((((....(((........)))))))))))....)))))))...))))))))))))))))))((((((..............)))))))))))).)))))..))))).)))))))..((((((....(((.((((..(((....)))........(((((.....))))))))))))....))))))((((((((((((...((((((.........))))))...........((((((..(((((...(((.((((((..((((((((((((((.............))).)))))))))..((((...))))...........(((((((.....(((((....)))))...)))))))))..))))))..)))...)))))..((((((((.....))))))))((((((.((((((.............(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...)))))))............)))))).))))))...((((......)))).........))))))..((..(((((((((.((.((((...(((((((...)))))))........)))).)).)))))))))..))...))))))))))))((..((((((((.....))))))))..)).....))))))))).))))))).......)))).))...)))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((......(((.....)))....))))....)))))))...................))))...))))..)))))))((((.....))))...((((....(((((((((((.(((.((.((....((((.......)))))).))..))).)))))..))))))...))))......)))).))))).))))))).)))))....)))))))))).(((.((((.(((......(((((((((............))))..)))))........))))))).)))........(((((............)))))((((((.......))))))))))))).......)))))))..))).)).))))......))))).))((.((((..(((((.........((((......))))..))))))))).)).))).)))))...)))).......)))))...(((((.(((.(((((...((((((((.....((..((((...(((...(((((...)))))...(((((((...)))))))...((((.........(((((.((((........))))))))).))))...))).))))..))....)))))))).))))).)))..)))))......(((....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..))))..{({((({,((((.....(((((((((((.(((((((((.(((,(({.({(((((.((((.....)))))))))...,..,,,.))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((..,..,,{{..{,(({(((({{,,((({{{.,,,.,,|,,..,,,...,))),))},))),.)).}|||,,,{{(((.,{,{|{{......{{{|.{{{|,,...((.({{((({(((({{{,,,....{{{....{,((({{{.{{,,,,..||,}}}||||||.}||,......|{({(({|,..,|{,.|,,,{,,,...,{,{(((((......))))))}}})),)}.}}}}..},||{||}|||,|,,..||||},.((((((((({.(((....))).}))))).)))}{{{.,,,((((.{{((((((..,,...,,.))))))}))))))...}))(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}})..)))){(((((((((((((...})))))},)))).))}...{,....,,...)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......{{{,....)}))))})},,,))},))))),..,})},,},)})))))),.))).}}.....,))),.,,,.))))))))))))))))...((((((.((...((((((...((,...,,,..}}}...((((((((((.,,..((({,(((({((({{((.((,{{{(((((({{.((..((,{......||..|,....,||,,,,..},,,.})))).....{((((,..(({....}}},,,.,((((({((,,,,{{{(((({((,.(((,...,}}}},,)))}.},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..},.}}})))))),}}..|||...,},.,))})))..,,..))).)))))))...))))))..)).))))))......{(.(((((.,,...((((.((...(((..(((((((.{((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.{(({{{{.,,{{.{(((..,{((.(((((((....(((((((.(((((((((((.(,,(((((((((((.,.......,,,,,,((((((........((({...((((..((({{{{{...,|...{{||{{{....((.....))..}}}..||{.((((((((({{(((((((...,((.(({(((({{{{..,{,,,,.,...(((((((.....))))))),,||,{((,(((((((((((((..((.(((......))).)).....)))))))),...,,,|,|||{..,{{{,|,,,,,,,,{{,,{,,,,,.}}}...((((((.........)).))))...,...}}}}|||||}.,((({{{.(((.....}},.,.)),}..}||||{{(((((((((...(((((...{(((((((,{(...,,...||}|||..,{{.((((.(((....(((.{({.((((((........))).))).})}.)))..})).))))..},}||||||....},)))))))}..)))))..))))))))).|}||,|,.,,.}}}}}},}))},,)}))))}}}}.)).,)))))))}...((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).)){{,...{((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))}..||,,,.,,||||,||.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..,,,))))},{{((({|{({.{{{.....))).))}.})))))},)))))))))..||((((((((.,((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...)))))),.})},......)))),,))).)).,...)))}}))))||(((({....(((((((.((...((((((((((....((((....)).))|(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},)))))))))))))),)))))..}}}..))}}..})}...,.(((.(((....))).))).))))))..))),,)).)))))))))))))...(((.((((((.....(((......((((((,........},)))))).....))).......)))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...{(({{,(({(((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.(((((.(({((((,...}))))}}))),{{{({{{{{{{{{||||,..,,,|||{{.(((((((((((((...(((((({.((((((((((....,(((..,,.,,|}}....,,,....{((({...)))),.(((((((.....,(((,((.(((,,(.((.(((((((....(((..{((.{{{............})},)}}...)))))))))).))))}}},,...,........,|,,,,|||,|{((((((....)))))}|}||{{{..(((.((((((....))))))..)))....,|,||{|,.....((.{((.(((....))))))))......,)))})))),)))))))...((((((...(((,,(((({,(.{.(((.((...,,.....,,)).)))..,.))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.{((.......,))).))))){{((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((.,({{.........,||(,{.(((((((((((((...((((.{{..((((((......)))))).}}))))....))))))...(((((.....)))))..,,(((..(((((({.(((,.,,...{{{{,..,,..}}},......,||...,)))))))))))))...))))))))))})),.............{((,.{(((..{{.(((((((..........))))))).))))))}).))))).)).)))....{{,((((.(((((((.............,))))))).))))}},,{{,{.......}.}}))..........))))))))))..))))},......,))).,.}))}}}}},..........{(((((((....{{{........})))))))))}....,))))))...)))))))))))))}}))}||||||.,},,.}},..,,,}},,,.)))))).)))))..))))).)))))))..((((((....{({.((({..(((....)))..,,,,..(((((.....)))))})))}}}....)))))){(((((((((((...((((((,........}}}}}}...{{,{....((((({.,|{{{,,{,{{{.((((({..((((((((((((((.....,,....||}||.}}||})}},,|{{{,..,,))},.......,,.,,|||||}},,,|{|{|....))}))...}},,}}}}}..})))))..)))...,,,,,..((((((((.....))))))))((((((.((((((.{(,..,......(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...))))))).........}),)))))).))))))...((({......))))..}}},...)))))}..((..(((((((((.((.((((,..(((((((...)))))))..}.....)))).)).)))))))))..))...)))))))))))){{..((((((((.....))))))))..}}.....))))))))).))))))).......)))).)}...}))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((...,..{{{.....}))....))))....)))))))...,||.......,,,,.,||||,..,,,,..)}}))))|,||,....}}}},,,(((({{,,((((({(((((.(((.{{,((,...((({.......))))},.}}..))).)))))..)))))}.,.}}))},,,..)))).))))).))))))).))))}....)))))))))}.,{{.,(((,,,.......(((((((((..,,....,,..))))..))))).,,....})}.,}},.....,,,,,,.||||,.,..,.,,},.,}}}}|((((((.{....}))))))))))))).......)))))))..))).)).))))...,,.))))).)}((.((((..(((((.......{,(({{....,.}}),.}))))))))).)).))).)))))...})}}......}))}}....,{{{,{((({((({{,,..((((({,,....})))))).,|||{{.{{(({{{.(((((.....(((((((...))))))).....))))}......(((((.(({(,.......))))))))),||{{..,})),)}}.},}))))})))}..,,.,,}}}......,|||,.....}|||....}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352722.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4958 nt 0.4492
NM_001352723.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4989 nt 0.4498
NM_001352724.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4971 nt 0.4484
NM_001352725.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5008 nt 0.4509
NM_001352726.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4944 nt 0.4511
NM_001352727.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4819 nt 0.4462
NM_001352728.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4807 nt 0.4500
NM_001352729.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4792 nt 0.4489
NM_001352730.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4880 nt 0.4471
NM_001352731.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4963 nt 0.4483
Showing 31 to 40 of 130 entries
Summary

This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.