Basic Information

Symbol
PTK2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Tyrosine Kinase 2 PPP1R71 FAK1 FAK FADK Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 71 Focal Adhesion Kinase-Related Nonkinase PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2 Focal Adhesion Kinase 1 EC 2.7.10.2 Pp125FAK P125FAK FADK 1 FRNK Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 71 FAK-Related Non-Kinase Polypeptide Protein-Tyrosine Kinase 2 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352702.2
Sequence length
5136.0 nt
GC content
0.4511

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1586.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352732.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4871 nt 0.4467
NM_001352733.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4859 nt 0.4476
NM_001352734.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4817 nt 0.4461
NM_001352735.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4875 nt 0.4480
NM_001352736.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4865 nt 0.4524
NM_001352737.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4928 nt 0.4499
NM_001352738.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4790 nt 0.4466
NM_001352739.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4893 nt 0.4457
NM_001352740.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4864 nt 0.4484
NM_001352741.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4757 nt 0.4471
Showing 41 to 50 of 130 entries
Summary

This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.