Basic Information

Symbol
PTK2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Tyrosine Kinase 2 PPP1R71 FAK1 FAK FADK Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 71 Focal Adhesion Kinase-Related Nonkinase PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2 Focal Adhesion Kinase 1 EC 2.7.10.2 Pp125FAK P125FAK FADK 1 FRNK Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 71 FAK-Related Non-Kinase Polypeptide Protein-Tyrosine Kinase 2 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352702.2
Sequence length
5136.0 nt
GC content
0.4511

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1586.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352742.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4733 nt 0.4469
NM_001352743.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4822 nt 0.4469
NM_001352744.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4688 nt 0.4469
NM_001352745.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4670 nt 0.4469
NM_001352746.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4625 nt 0.4471
NM_001352747.2 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 5141 nt 0.4449
NM_001352749.2 NCBI
GUCAUUAUUAGAACUCUAGAGUUGUAGGAAUGUAGGAAGAGCUGUUUGC… 2957 nt 0.4491
NM_001352750.2 NCBI
GUCAUUAUUAGAACUCUAGAGUUGUAGGAAUGUAGGAAGAGCUGUUUGC… 2948 nt 0.4484
NM_001352751.2 NCBI
GUCAUUAUUAGAACUCUAGAGUUGUAGGAAUGUAGGAAGAGCUGUUUGC… 2894 nt 0.4475
NM_001352752.2 NCBI
GUCAUUAUUAGAACUCUAGAGUUGUAGGAAUGUAGGAAGAGCUGUUUGC… 2885 nt 0.4468
Showing 51 to 60 of 130 entries
Summary

This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.