Basic Information

Symbol
PTK2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Tyrosine Kinase 2 PPP1R71 FAK1 FAK FADK Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 71 Focal Adhesion Kinase-Related Nonkinase PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2 Focal Adhesion Kinase 1 EC 2.7.10.2 Pp125FAK P125FAK FADK 1 FRNK Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 71 FAK-Related Non-Kinase Polypeptide Protein-Tyrosine Kinase 2 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352702.2
Sequence length
5136.0 nt
GC content
0.4511

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1586.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..)))).....(((((((((.....(((((((((((.(((((((((.(((.(((.(((((((.((((.....)))))))))......))..))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((...........((((.((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.((.........)))).))))...((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).))......)))).....))))))))))))))))...((((((.((...((((((...(((........)))...((((((((((.....(((((((((((((((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).....((((((..(((....)))....(((((((((.......(((((((..(((....)))))).))))........)))))))))((((......))))((((..((((((....)))))).))))))))))((......)).))))))))).....(((........))))))......))).)))))))...))))))..)).))))))......((.(((((......((((.((...(((..(((((((.(((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.(((((((.((((.((((....((.(((((((....(((((((.((((((((.(((.......)))((.(((.(((..(((((((((((..((..((((((((....((((((((((.............)))).....((.....)).((((..(((......))).)))).(((((..(.(((.....))).)..)))))........))))))...))))))))..))..)))))..(((((((((..((.(((......))).)).....))))))))).....)))))).)))))).)).......(((((......))).))((((((.........)).))))......((((.((((((..((((((((((.........)))).....(((((((((((((((...(((((...((((.((((((........))))))......((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))))))..)))))..))))))))).)))))).....)))))).(((((.(((......)))..))))).......((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....((..((((((.((.(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..))))))))..))..........((((((.(((.(...((((.(((((((((((.((((((.....(((..((.(((.(((..((.((.((((((((.((...........((((((..((..............))..))))))((((........)))))))))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).))).)).))..)))))).)).)))..(((.(((....))).))).(((((((......))))))).......)))))))))))).......))))).))))...).))).)))))).))))))))))(((((........))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...(((((.((((((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.((.(((((((((..((....(((.(......).)))....)))))))))))(((((.(((((((((((((...(((((((.((((((((((.....(((..((....))....)))....(((((...))))).((((((.......((((((..(((((.((((((((((....(((..(((.(((............))).)))...)))))))))).(((((((.....((.......))....)))))))(((((....)))))))).))).))(((.((((((....))))))..))).......((((......((.(((.(((....))))))))......)))).))))))))))))...((((((...((((.(((((.(.(.(((.((............)).)))..).))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.(((........))).)))))((((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((..(((.........)))((((.((((((((((((...((((.....((((((......))))))...))))....))))))...(((((.....)))))....(((..(((((((.(((.........(((......))).......(((....)))))))))))))...)))))))))))))..............((((.(((......(((((((..........))))))))))..)))).))))).)).))).......((((.(((((((..............))))))).))))..((((.(.......).))))..........))))))))))..))))........))))...))))))))...........((((((((....(((........)))))))))))....)))))))...))))))))))))))))))((((((..............)))))))))))).)))))..))))).)))))))..((((((....(((.((((..(((....)))........(((((.....))))))))))))....))))))((((((((((((...((((((.........))))))...........((((((..(((((...(((.((((((..((((((((((((((.............))).)))))))))..((((...))))...........(((((((.....(((((....)))))...)))))))))..))))))..)))...)))))..((((((((.....))))))))((((((.((((((.............(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...)))))))............)))))).))))))...((((......)))).........))))))..((..(((((((((.((.((((...(((((((...)))))))........)))).)).)))))))))..))...))))))))))))((..((((((((.....))))))))..)).....))))))))).))))))).......)))).))...)))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((......(((.....)))....))))....)))))))...................))))...))))..)))))))((((.....))))...((((....(((((((((((.(((.((.((....((((.......)))))).))..))).)))))..))))))...))))......)))).))))).))))))).)))))....)))))))))).(((.((((.(((......(((((((((............))))..)))))........))))))).)))........(((((............)))))((((((.......))))))))))))).......)))))))..))).)).))))......))))).))((.((((..(((((.........((((......))))..))))))))).)).))).)))))...)))).......)))))...(((((.(((.(((((...((((((((.....((..((((...(((...(((((...)))))...(((((((...)))))))...((((.........(((((.((((........))))))))).))))...))).))))..))....)))))))).))))).)))..)))))......(((....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..))))..{({((({,((((.....(((((((((((.(((((((((.(((,(({.({(((((.((((.....)))))))))...,..,,,.))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((..,..,,{{..{,(({(((({{,,((({{{.,,,.,,|,,..,,,...,))),))},))),.)).}|||,,,{{(((.,{,{|{{......{{{|.{{{|,,...((.({{((({(((({{{,,,....{{{....{,((({{{.{{,,,,..||,}}}||||||.}||,......|{({(({|,..,|{,.|,,,{,,,...,{,{(((((......))))))}}})),)}.}}}}..},||{||}|||,|,,..||||},.((((((((({.(((....))).}))))).)))}{{{.,,,((((.{{((((((..,,...,,.))))))}))))))...}))(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}})..)))){(((((((((((((...})))))},)))).))}...{,....,,...)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......{{{,....)}))))})},,,))},))))),..,})},,},)})))))),.))).}}.....,))),.,,,.))))))))))))))))...((((((.((...((((((...((,...,,,..}}}...((((((((((.,,..((({,(((({((({{((.((,{{{(((((({{.((..((,{......||..|,....,||,,,,..},,,.})))).....{((((,..(({....}}},,,.,((((({((,,,,{{{(((({((,.(((,...,}}}},,)))}.},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..},.}}})))))),}}..|||...,},.,))})))..,,..))).)))))))...))))))..)).))))))......{(.(((((.,,...((((.((...(((..(((((((.{((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.{(({{{{.,,{{.{(((..,{((.(((((((....(((((((.(((((((((((.(,,(((((((((((.,.......,,,,,,((((((........((({...((((..((({{{{{...,|...{{||{{{....((.....))..}}}..||{.((((((((({{(((((((...,((.(({(((({{{{..,{,,,,.,...(((((((.....))))))),,||,{((,(((((((((((((..((.(((......))).)).....)))))))),...,,,|,|||{..,{{{,|,,,,,,,,{{,,{,,,,,.}}}...((((((.........)).))))...,...}}}}|||||}.,((({{{.(((.....}},.,.)),}..}||||{{(((((((((...(((((...{(((((((,{(...,,...||}|||..,{{.((((.(((....(((.{({.((((((........))).))).})}.)))..})).))))..},}||||||....},)))))))}..)))))..))))))))).|}||,|,.,,.}}}}}},}))},,)}))))}}}}.)).,)))))))}...((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).)){{,...{((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))}..||,,,.,,||||,||.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..,,,))))},{{((({|{({.{{{.....))).))}.})))))},)))))))))..||((((((((.,((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...)))))),.})},......)))),,))).)).,...)))}}))))||(((({....(((((((.((...((((((((((....((((....)).))|(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},)))))))))))))),)))))..}}}..))}}..})}...,.(((.(((....))).))).))))))..))),,)).)))))))))))))...(((.((((((.....(((......((((((,........},)))))).....))).......)))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...{(({{,(({(((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.(((((.(({((((,...}))))}}))),{{{({{{{{{{{{||||,..,,,|||{{.(((((((((((((...(((((({.((((((((((....,(((..,,.,,|}}....,,,....{((({...)))),.(((((((.....,(((,((.(((,,(.((.(((((((....(((..{((.{{{............})},)}}...)))))))))).))))}}},,...,........,|,,,,|||,|{((((((....)))))}|}||{{{..(((.((((((....))))))..)))....,|,||{|,.....((.{((.(((....))))))))......,)))})))),)))))))...((((((...(((,,(((({,(.{.(((.((...,,.....,,)).)))..,.))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.{((.......,))).))))){{((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((.,({{.........,||(,{.(((((((((((((...((((.{{..((((((......)))))).}}))))....))))))...(((((.....)))))..,,(((..(((((({.(((,.,,...{{{{,..,,..}}},......,||...,)))))))))))))...))))))))))})),.............{((,.{(((..{{.(((((((..........))))))).))))))}).))))).)).)))....{{,((((.(((((((.............,))))))).))))}},,{{,{.......}.}}))..........))))))))))..))))},......,))).,.}))}}}}},..........{(((((((....{{{........})))))))))}....,))))))...)))))))))))))}}))}||||||.,},,.}},..,,,}},,,.)))))).)))))..))))).)))))))..((((((....{({.((({..(((....)))..,,,,..(((((.....)))))})))}}}....)))))){(((((((((((...((((((,........}}}}}}...{{,{....((((({.,|{{{,,{,{{{.((((({..((((((((((((((.....,,....||}||.}}||})}},,|{{{,..,,))},.......,,.,,|||||}},,,|{|{|....))}))...}},,}}}}}..})))))..)))...,,,,,..((((((((.....))))))))((((((.((((((.{(,..,......(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...))))))).........}),)))))).))))))...((({......))))..}}},...)))))}..((..(((((((((.((.((((,..(((((((...)))))))..}.....)))).)).)))))))))..))...)))))))))))){{..((((((((.....))))))))..}}.....))))))))).))))))).......)))).)}...}))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((...,..{{{.....}))....))))....)))))))...,||.......,,,,.,||||,..,,,,..)}}))))|,||,....}}}},,,(((({{,,((((({(((((.(((.{{,((,...((({.......))))},.}}..))).)))))..)))))}.,.}}))},,,..)))).))))).))))))).))))}....)))))))))}.,{{.,(((,,,.......(((((((((..,,....,,..))))..))))).,,....})}.,}},.....,,,,,,.||||,.,..,.,,},.,}}}}|((((((.{....}))))))))))))).......)))))))..))).)).))))...,,.))))).)}((.((((..(((((.......{,(({{....,.}}),.}))))))))).)).))).)))))...})}}......}))}}....,{{{,{((({((({{,,..((((({,,....})))))).,|||{{.{{(({{{.(((((.....(((((((...))))))).....))))}......(((((.(({(,.......))))))))),||{{..,})),)}}.},}))))})))}..,,.,,}}}......,|||,.....}|||....}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001387584.1 NCBI
CACACCGCGGAAGCCCGGGUCGGUGUCGGGGCGAGCCUUCCCUCCUUUU… 4154 nt 0.4415
NM_001387585.1 NCBI
CACACCGCGGAAGCCCGGGUCGGUGUCGGGGCGAGCCUUCCCUCCUUUU… 4258 nt 0.4439
NM_001387586.1 NCBI
CACACCGCGGAAGCCCGGGUCGGUGUCGGGGCGAGCCUUCCCUCCUUUU… 4321 nt 0.4450
NM_001387587.1 NCBI
CACACCGCGGAAGCCCGGGUCGGUGUCGGGGCGAGCCUUCCCUCCUUUU… 4410 nt 0.4465
NM_001387588.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 2299 nt 0.4224
NM_001387589.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 2466 nt 0.4331
NM_001387590.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4138 nt 0.4512
NM_001387591.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4183 nt 0.4497
NM_001387592.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4191 nt 0.4524
NM_001387603.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4192 nt 0.4501
Showing 61 to 70 of 130 entries
Summary

This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.