Basic Information

Symbol
PTK2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Tyrosine Kinase 2 PPP1R71 FAK1 FAK FADK Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 71 Focal Adhesion Kinase-Related Nonkinase PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2 Focal Adhesion Kinase 1 EC 2.7.10.2 Pp125FAK P125FAK FADK 1 FRNK Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 71 FAK-Related Non-Kinase Polypeptide Protein-Tyrosine Kinase 2 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352702.2
Sequence length
5136.0 nt
GC content
0.4511

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1586.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001387614.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4350 nt 0.4529
NM_001387615.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4353 nt 0.4542
NM_001387616.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4358 nt 0.4555
NM_001387617.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4379 nt 0.4517
NM_001387618.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4393 nt 0.4528
NM_001387619.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4394 nt 0.4556
NM_001387620.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4409 nt 0.4495
NM_001387621.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4416 nt 0.4561
NM_001387622.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4431 nt 0.4538
NM_001387623.1 NCBI
ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… 4434 nt 0.4502
Showing 81 to 90 of 130 entries
Summary

This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.