Basic Information
Symbol
PTN
RNA class
mRNA
Alias
Pleiotrophin
HBNF
HBGF8
NEGF1
Heparin-Binding Neurite Outgrowth-Promoting Factor 1
Heparin-Binding Growth-Associated Molecule
Heparin-Binding Growth Factor 8
Heparin-Binding Brain Mitogen
Osteoblast-Specific Factor 1
HB-GAM
HBGF-8
HBNF-1
OSF-1
HBBM
Pleiotrophin (Heparin Binding Growth Factor 8, Neurite Growth-Promoting Factor 1)
Heparin-Binding Neurite Outgrowth Promoting Factor
Heparin-Binding Neurite Outgrowth-Promoting Factor
Neurite Growth-Promoting Factor 1
Heparin Affin Regulatory Protein
Heparin Binding Growth Factor 8
HBNF1
HARP
Location (GRCh38)
7:137227341-137344358
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
Mechanical injury analysis
MANE select
Transcript ID
NM_002825.7
Sequence length
1482.0 nt
GC content
0.4170
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-384.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-415.03 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
329.6
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AAGGGGAAAUAAGGGACAAGAGAGACCCUCUCAUAUUGUUUUAUAUUAU… | 1740 nt | 0.4126 | |
| AUUCUCCAUUUCCCUUCCGUUCCCUCCCUGUCAGGGCGUAAUUGAGUCA… | 1479 nt | 0.4165 | |
| AUUCUCCAUUUCCCUUCCGUUCCCUCCCUGUCAGGGCGUAAUUGAGUCA… | 1482 nt | 0.4170 |
Summary
The protein encoded by this gene is a secreted heparin-binding growth factor. The protein has significant roles in cell growth and survival, cell migration, angiogenesis and tumorigenesis. Alternative splicing and the use of alternative promoters results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2016]
Forensic Context
A review of human multi-omics studies for biological age estimation identified pleiotrophin (PTN) as a top protein associated with aging in a plasma SOMAscan analysis [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192]. Furthermore, in a study of contusive spinal cord injury in Fischer 344 rats, the PTN gene was found to be decreased in the injury epicenter sample early after the trauma [Aimone et al. DOI:10.1016/j.expneurol.2004.05.042].