Basic Information

Symbol
PVR
RNA class
mRNA
Alias
PVR Cell Adhesion Molecule Poliovirus Receptor Necl-5 CD155 NECL5 Tage4 HVED PVS Nectin-Like Protein 5 Nectin-Like 5 CD155 Antigen NECL-5
Location (GRCh38)
19:44643798-44666162
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006505.5
Sequence length
5792.0 nt
GC content
0.5205

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2236.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2333.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1184.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135768.3 NCBI
AGUCACUUGUCUGGAGCUUGAAGAAGUGGGUAUUCCCCUUCCCACCCCA… 5657 nt 0.5209
NM_001135769.3 NCBI
AGUCACUUGUCUGGAGCUUGAAGAAGUGGGUAUUCCCCUUCCCACCCCA… 5633 nt 0.5205
NM_001135770.4 NCBI
AGUCACUUGUCUGGAGCUUGAAGAAGUGGGUAUUCCCCUUCCCACCCCA… 1531 nt 0.6022
NM_006505.5 NCBI
AGUCACUUGUCUGGAGCUUGAAGAAGUGGGUAUUCCCCUUCCCACCCCA… 5792 nt 0.5205
Summary

The protein encoded by this gene is a transmembrane glycoprotein belonging to the immunoglobulin superfamily. The external domain mediates cell attachment to the extracellular matrix molecule vitronectin, while its intracellular domain interacts with the dynein light chain Tctex-1/DYNLT1. The gene is specific to the primate lineage, and serves as a cellular receptor for poliovirus in the first step of poliovirus replication. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2008]

Forensic Context

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