Basic Information

Symbol
PXDC1
RNA class
mRNA
Alias
PX Domain Containing 1 C6orf145 PX Domain-Containing Protein 1 PX Domain-Containing Protein C6orf145 Chromosome 6 Open Reading Frame 145
Location (GRCh38)
6:3722614-3751713
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_183373.4
Sequence length
1878.0 nt
GC content
0.5724

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-737.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -772.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 428.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_183373.4 NCBI
ACUCGCCGCCGCGCCGCCCCGCUGCCCCGAACGCGGGCCAUACGCAGCC… 1878 nt 0.5724
Summary

Predicted to enable phosphatidylinositol binding activity. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PXDC1 was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term (0-5 month) weight loss in obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].