Basic Information

Symbol
PXT1
RNA class
mRNA
Alias
Peroxisomal Testis Enriched Protein 1 STEPP Small Testis-Specific Peroxisomal Protein Peroxisomal Testis-Specific Protein 1 Peroxisomal, Testis Specific 1
Location (GRCh38)
6:36390551-36442854
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_152990.4
Sequence length
2073.0 nt
GC content
0.4385

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-526.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -565.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 639.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_152990.4 NCBI
AGUCCACUCUGCACCCAACCUCAGCGGGCGCACUUUUCUGAGUUGCGCA… 2073 nt 0.4385
Summary

Predicted to be involved in spermatogenesis. Predicted to act upstream of or within positive regulation of apoptotic process. Predicted to be located in nucleus and peroxisome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans and mice identified PXT1 as a gene located in the KCTD20/STK38 region that previously neared genome-wide significance for cocaine dependence in a prior analysis of the same sample [Huggett et al. DOI:10.1111/Adb.12719].