Basic Information

Symbol
RAB10
RNA class
mRNA
Alias
RAB10, Member RAS Oncogene Family Ras-Related GTP-Binding Protein Ras-Related Protein Rab-10 GTP-Binding Protein RAB10 EC 3.6.5.2
Location (GRCh38)
2:26033481-26138436
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016131.5
Sequence length
3561.0 nt
GC content
0.4122

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-973.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1044.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 920.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_016131.5 NCBI
GUCUCAGGCAGCGCGCACGCCGGCGUGAGAGGGCACGGGGAAAAGGUGG… 3561 nt 0.4122
Summary

RAB10 belongs to the RAS (see HRAS; MIM 190020) superfamily of small GTPases. RAB proteins localize to exocytic and endocytic compartments and regulate intracellular vesicle trafficking (Bao et al., 1998 [PubMed 9918381]).[supplied by OMIM, Mar 2009]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the protein level of ras-related protein rab-10 was downregulated by transfection with a mimic of the RAB10 in primary cardiomyocytes, though this effect was not statistically significant [Xue et al. DOI:10.1161/JAHA.122.026160].