Basic Information

Symbol
RAB17
RNA class
mRNA
Alias
RAB17, Member RAS Oncogene Family Ras-Related Protein Rab-17 EC 3.6.5.2
Location (GRCh38)
2:237574322-237601623
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022449.4
Sequence length
1603.0 nt
GC content
0.5889

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-689.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -718.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 360.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022449.4 NCBI
GCCCUGAAACCUUCUGGGAGGAGAAGAGGCCUGACCUUGGCGCUGGGGU… 1603 nt 0.5889
Summary

The Rab subfamily of small GTPases plays an important role in the regulation of membrane trafficking. RAB17 is an epithelial cell-specific GTPase (Lutcke et al., 1993 [PubMed 8486736]).[supplied by OMIM, Oct 2009]

Forensic Context

A study in mice and humans demonstrated that the angiogenesis capacity of diabetic foot ulcers was related to the dysregulation of the RAB17 expression in human dermal microvascular endothelial cells (HDMECs) [Cheng et al. DOI:10.1093/burnst/tkae043].