Basic Information

Symbol
RAB20
RNA class
mRNA
Alias
RAB20, Member RAS Oncogene Family Ras-Related Protein Rab-20 FLJ20429 EC 3.6.5.2
Location (GRCh38)
13:110523066-110562127
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017817.3
Sequence length
1507.0 nt
GC content
0.5760

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-608.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -635.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 304.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017817.3 NCBI
GCUCUGCACCCAGCUCCUUCCCGGGCGCGCACACGCGCUUCCUCUCUUG… 1507 nt 0.5760
Summary

Predicted to enable GTPase activity. Involved in phagosome acidification and phagosome-lysosome fusion. Located in Golgi apparatus and phagocytic vesicle. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human patients identified the RAB20 as one of six key cluster-specific genes for distinguishing sepsis subgroups with distinct inflammatory responses and therapeutic strategies [Chen et al. DOI:10.3389/fimmu.2023.1298041].