Basic Information

Symbol
RAB6B
RNA class
mRNA
Alias
RAB6B, Member RAS Oncogene Family Ras-Related Protein Rab-6B Small GTP-Binding Protein Small GTPase RAB6B EC 3.6.5.2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_016577.4
Sequence length
5596.0 nt
GC content
0.5079

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2053.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2154.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1396.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((.(((((..(.(((((((((.((((((..(((((((((.((((((((...((((....))))...)))....))))))))...).)))))..))))))...))))).))))).)))))))).)))((((((.......))))))..(((((((((((((((((((((.((.((.(((.(((((((((((((((((.(((..((((((((((..(((((((.((((.((..((((((.(((((((..((((((((..((((...(((.((((((.((((((((.(((..((.((((...........))))...))..)))))...((........))...............)))))))))))).)))...))))..........)))))))).)))))))........))))))..)).)))).....))))(((((((.(((...........(((.(..((((((((((((((((((.....)))).)))))....((((((((......))..))))))..........(((((..((...(((..(((((.....)))))...))).)).)))))...(((....)))((.((((.((.(((.(((...((((((...(((.(((((....)))))..)))))))))...))).)))))...)))).))(((((((........)))))))........)))).))))).).)))))).))))))).(((...))).))).)))))))))).((((((....))))))(((....)))........(((.((((((((((.((((((((((((...((((((((((((((.((((((.(((((.(((....(((((((.....((.(((((......)))))))..)))))))..))).))))).).)))))((.(((((((((.........((.(..(((((((.................((((.....))))...)))))))..).))((((((..(((.((.....)).)))..))))))((....)))))))))))))...)))))))......)))))))...))))).))))))).))))))))))..)))...))).))))).....((((((((((((((((((((........))))).)))))))..(((((((((((((.((((((((((((..(((((..(((((((((((.....(((((((.((((.....)))).....((((((((..((((.(((((..........))))).))))))))))))))))))).(((((((.....))))))).)))))....(((....))).((((((((((((....))))))))))))..((((((((...........))))))))......(((.(((((((.........................))))))).))).......))).))).))))).)))))).)))))).)))..................(((((((...........)).))))).(((((((....)))))))........))))))))))............((..((((((.....))))))..))....))))))))..(((((.(((.......))).))))).((((.(((..(((.....))).))))))))))).))).)))))...))).))..((.(((((..((....))..))))).))((((((((((((...(((((....((((((....))))))(((((((((((.(((.....))).)))))))))))))))).((((..........))))..))))))).))))))).)))))).))))..)))))..)))))).(((((.((((((..(((.(((((((((((.(((.........................)))..))))))))))...).))).))))))..)))))...(((.(((.(((((((((((((((..(((((.....(((....)))..)))))((((..(((.(.(((((((.....((.(((.((((((.(((..(((((((((((((((((((((((.(((.((.((((((.(((....(((((((((((((((((((((..........)))))).))).((((.(((.(((...((((.(((((((...(((....))))))))))))))....))).))).)))).........((((((((.(((....))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))...((((((((((..((((((((((((((.....................))).)))))))....(((((((....((((((....(((((((....)))))))...(((((((........)))))))....((((((((...((((((((((((((((((((.((((((.....).))))).))..))))))))))))))..............((((((.((((....((((((.(...((((((..(((((((....)))).)))...)).))))).)))))).....))))...)))))).............)))).)))))))).))))))....))))))).......))))....))))))))))..(((((((((.....(((((((((.((...(((.((((((((((((...(((.(((((.....))))).))).(((.((((.....)))).))).........(((((....))))).........)))))..))))))).)))...((((((.((.(((((..((((((((((((.....)))))))...((((((((.((........((((((((((((...(((......)))...)))))))))))).....))))))))))......(((((.((((((((.....)))))....))).))))).........)))))..))))).)).)).))))((((((....))))))....((((...((((((..(((((..(((....((((....))))....)))....)))))...))))))......))))..((((((((((((((..((.((((((((.(((((((((............)))))((((((...))))))...((((((((...((((.(((((..........))))))).))))))))))......((((((..(((((.(.((((.....((((........((((((..(((.((.((((.(((..(((((..(((..(((..((((((((((.....)))))))))).....))))))....)))))..))))).)))).))).))))))........))))((((((((((((..(((...((((((......))))))..........)))..)))..))))))).))....((((....))))))))...).))))))))))))))).)))))))))).((((.......))))((...........))...))))))))))))))....)).)))))))))....)).)).)))))))))))))))))))....(((.(((....))).)))((((((((((...))))))))))......))))))..))))))))).))).))))))).)).).))))))))))))..((((...)))).((((((((.(((((((((....((((((((((((.((((((((((.(((...(((..((.(((((((((((....(((((((...............)))))))..........)))).))))))).))..)))......(((....)))))).)))))))))).))).))))..)))))..))))))))).)))....((((.((((((((((.(((....)))))))))))))))))...))))).(((((...))))).(((((......))))).((((.((((((((((((((((..(((.(.(.((.((..((((.....))))..)).)))).))))))))))))).)).)))).))))((.(((...((((...(((((((.(((......(((((...)))))((((((.....)))).))..(((((((....((.....))........((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((.(..(((.(.(((((..(((.......))).))))).).).))..).))))))..(((((.(.....).)))))....((((((((((.((.((((..((.(((.(((((((((((.......((.((((((((((.......(((..(((((......)))))...)))...)))))))))).))(((..((((.(((((((.((((((....)))).....))))))))))))))))........((((((((.((((...))))....))))))))....(((((.....))))).))))))))))))))))..)))).))..)))))..))))).((((....)))).....((((..(((((((...........((((...(((.((....)).)))))))((((((.((((((.(.((....((((..(((((.((...(((((........)))))..)).)))))((((((((..........(((((..((((((((.(((.(.....).)))))))))))..))..)))...)))))))).))))....)).)..)))))).))))))(((.((((((.(((...))).)))))).)))..((((((((((....)))))))))).)))))))..))))((((...))))......))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))))))).......(((((((((((.(((((....(((((((....)))))))..(((((((((.....)))))))))..(((.((.....)).))).((((.((((...((((..(((((.....)))))..)))).....)))))))).....(((((.((((.(((((.((((........))))..)).))).))))))))).((((.....))))(((((((.(((.(((((((((....(((((((.........(((...((((((((((((.(((((((....))))))).))...((.(((.....))).))....((((((((.((((((((.....))))).......((((((.....))))))....)))))))))))))))))))))..)))((((((.....))))))......)))))))....)))).)))).)..))).))))))).......((((((...((..((((.............))))..))..)))))).))))).))))))))))))))))))))))))))))...))))....))).))((((((((((((((((..((...))..))))))))).....)))))))((((......))))..)))).))))))..)))..)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,((((((.(((((.,(.(((((((((.((((((,(((((({(((.((((((({..,((((....}}}),,,)},...}))))))))...).))))).}))))))...))))).))))).)))))))))})}((((((.......)))))),.(((((((((((((((((((((.((.((.(((.(((((((((((((((((.(((,.((((((((((,{((((,{,.((((.((..((((((.(((((((..((((((((..((((.{.(((.((((((.((((((.(,({(..((.{({{...........))))...))..})),|{,.{........,))}..............}))))))))))).)))...,,,...........)))))))).)))))))........))))))..)).)))).....}}||(((((((.(((...........(((.{..{(((((((((((((((((.....)))).)))))....(((((((,.,,,..}}.,))))))..........(((((...,{,,{((..(((((.....)))))...)))}},.}}|||,,.{((....}}}((.((((.{(.(((.(((...((((((...(((.(((({....}))))..)))))))))...))).)))))...)))).))|{||(((,,,,....))))))}........)))),,)))).}.)))))).))))))).(((...)))}))).)))))))))).{(((((....)))))|{({....))),.......(((.((((((((((.((((((((((((.,.((((((((((((((.((((({(({.(({{{({,,.|||,|||}.}||,{.,((((......))))|((((||(((((({......}))),,))))))))(((((((((..,,.....||.,..(((((((.................((((.....))))...)))))))..,.}|((((((..(((.((.....)).)))..))))))|{....)}))))))))).,}}.)))))))......))))))).,.))))).))))))).))))))))))..)))...))),)))))}....((((((((((((((((((((........))))),)})))))..(((((((((((((.((((((((((((..(((((..((((({{{{{{.....(((((((.((((.....)))).....{(((((((..{(((.(((((..........))))).)))})))))))}))))))).(((((((.....))))))}.,}}}}....{{{....}}}.((((((((((((....))))))))))))..{(((((((...........)))))))}......,{{.(((((((.........................))))))).}}}.......))).))).))))).)))))).)))))).)))..................(((((((..,.....,..))}})))).(((((((....)))))))........)))))))))).,,,........|,..((((((.....))))))..}}....)))))))).,(((((.(((.......))).))))).((((.(((..(((.....))).))))))).})).))).)))))...))).))..((.(((((..((....))..))))),)}{(((((((((((...(((((....,{({{{...,))))}|(((((((((((.(((.....))).)))))))))))))}}}.((((..........))))..))))))).))))))).))))))},)))..)))))..)))))).{((((.((((((,,(((,{((((((((((.(((...............,.........)))..))))))))))...|,})).})))))..)}}),,,,|||||{{.||{((((((((((((..(((((...,.(((....))).,)))))((((..(((.(.(((((((.....((.(((.((((((((((.,(((((((((((((((((((((((.(({{((.((((({,(((....(((((((((((((((((((((..........)))))).))).{(((.(((.(((...(((,,(((((((...(((....)))))))))))))).,..))}.))).}))),........((((((((.(((....))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))}..((((((((((..((((((((((((((.....................)))}}))))))....(((((({....((((({....(((((((....)))))))...(((((((........)))))))....((((((({...(((((((((((((((((({{.((((((.....),})))).)}..)))))))))))))),.......|,....((((((.{((({,.,((((((.{...(((({{.,(((((((....)))).)))...)}.))))}.)))))),,.,.))))...)))))).,..,,.......)))).)))))))).})))))....))))))).......))))....))))))))))..((((((({({,...(((((((((.((..,{{,((((,(((,,((.,,,|,,}||,||}}.,,}||||{|||.,|{|||{||{|,|({{{{({,{({{.....(((((....))))),{{{{((((((((((...{(,(((((((.,(((((.....)))))|.,..,.{{{{{{,.{{{{|||,|}||,.((((((((.((........((((((((((((.,.({{......)))...)))))))))))).....))))))))))...,..,))}}}}}..))))))}.,),,,..}}})))}}}}||,,||},,.||}.}}|,|||(({{{((,.,.{.((((({....|}}}}}.|,.,|||,.|{{{{||..|{{{|,,|||.,..||{{,,,,}}}}.,,,}||,|,,}}}}},..}}},},..,|||||}|.||||||||,,,||||,.((.((((((((.((((((((,....,,,.....,,,,,,{{({,...,}}}}|{{,((({{{{,.,|||||||{(((...{,,,.,,}}}},,},)))})))),)}}....((((((,.{((((.(.((({{...,,,((,.{,{,,.((((((..(((.((.{{((.(((..(((((..(((.,(({..((((((((((.....))))))))))...},)}))))....)))))..))))).)))).))).))))))...,.,,,||}}{,{{(({,{{,,..,{{{..,,,,,,...}}},,,,,}.,,,,,..,.}}},,.,..||},},.},},.||,{{{{,,,,)))))})).,.}.))))))))))))))).)))))))))).}})}.}.,}}})))}}}.,,........)).}})))),,,}}},))))}}.)).))))))))).,,,,,.)).))))),)))))))))))))....,..,(((....,))}||{((((((((((...)))))))))).}}},.))))))..))))))))).))).))))))).)).).)))))))))))){.((((...)))),((((((((.(((((((((.,..((((((((((((.((((((((((.{(({,.(((..((.(((((((((((,,,.((((({{......,,},.....}}}}}}).,}.,,....)))).))))))).))..))),,},..{{|....}},))),)))))))))).))).))))..))))),.))))))))).)))....((((.((((((((({{(((....)))))))))))))))))...))))).{((({...})))}.(((((......))))).{(((.(((((((((((((((({{(((.(.({(((({,......,)))).))}})},)).,.,,,)))))))))).)).)))).)))|(((((((.........{((((.......))))|((((.{{({{{.{({.((({..{{{,,{(((..,(((((({...((.....))........,{((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((...{{{{(,,{..,,|},.(((((..{,(,,.....})),))}}).},|{||{,|,||}||,..(((((.(.....).))))).,||{{,..,)})),({.((((..((.(((.(((((((((((,,.{{,{(({((((((((((..,....(((..(((({......})))}...}))...)))))))))}.}}{{{..{{{{{(((((((.,{((((....))))....,)}))))))}))))))),}....{,((((((((.{{{{...}}})....))))))))}...(((((.....))))).)))))))))))))))),.)))}.}),{{((((((({....((((....)))){(((({(((,.(((((((........(({.(((((({(((((.,....,})))))..})))))).))))))))))...}})).))))|{,|||{,{(((((((.,{{{{{{{{..},..,,,(((((((((.,.....{,.,((((..((((((((.(((.(.....).)))))))))))..)))))),...))))))))).,,..}}..,,),,}}))))})),)}}|||}||{(({.(((...))).})))))})))},|(((((((((....)))))))))}{{|...}))..,,|{|{|.,.}))),.....))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))}})))))}}||)},,}}|}|||,|}...(((((((....)))))))..,((((((((.....))))))))((((((((...,,,||{{{,,((((.((((...((((..(((((.....)))))..)))).....))))))))....,{({((.{{({.(((({,(({{........))))..)),))),))}}})}}}.{|||.,...))),,}|)))))))).)}||.}}||,}}}|}}||......,{(((((((,,({,{{,{{,{(({{{{{{{,.,,,)}})}}}.}},,,||.|||,},,,|}|||,,||{((((((((,(({(((((.....))))),,,{{{.((((((.....))))})}..})))))))))))}.)}}))}}||,{||{(((((,,,..}))}}),......))}))),..,))}}}}}}}.|||||}||||||},,{||{.{(({{,,...{,{{(((({{{,,.{,....,),)).,))..)))))).},||||}}||}}}},,,}))})))},..})))}},))))))}}},||||}(((((((((((((((((..{{...}}..))))))))).....)))))))).}})),,,,}}}...))))})),},,..,}}..}}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGGGGGCCGACUGGCGCGGCUCUGGAGAGCGCUCCUCCGCCCCGCGCGC… 5688 nt 0.5084
ACAGAGCGCAGGCGCCGGCGGAGGAGGCAGGCGGGAGGGGGCCGACUGG… 5596 nt 0.5079
Summary

Enables myosin V binding activity. Involved in Golgi organization and protein localization to Golgi membrane. Located in Golgi membrane; ciliary basal body; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques demonstrated that chronic ethanol self-administration is associated with broad transcriptomic changes, where the RAB6B was identified as a positively correlated hub gene within a coexpression network in the central nucleus of the amygdala, indicating its role in neural mechanisms related to excessive ethanol consumption [Iancu et al. DOI:10.1111/Adb.12501].