Basic Information

Symbol
ATP12A
RNA class
mRNA
Alias
ATPase H+/K+ Transporting Non-Gastric Alpha2 Subunit Potassium-Transporting ATPase Alpha Chain 2 H-K-ATPase ATP1AL1 HK ATPase, H+/K+ Transporting, Nongastric, Alpha Polypeptide ATPase, Na+/K+ Transporting, Alpha Polypeptide-Like 1 Non-Gastric Na(+)/K(+) ATPase Subunit Alpha Proton Pump Sodium Pump HK Alpha 2 ATPase, Na+K+ Transporting, Alpha-1 Polypeptide-Like Sodium/Potassium ATPase, Alpha Polypeptide-Like Non-Gastric H(+)/K(+) ATPase Alpha Subunit Non-Gastric H(+)/K(+) ATPase Subunit Alpha EC 7.2.2.19 EC 7.2.2.13 EC 3.6.3.10 EC 3.6.3
Location (GRCh38)
13:24680408-24712472
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001676.7
Sequence length
4406.0 nt
GC content
0.5191

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1487.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1572.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1190.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001185085.2 NCBI
CUCAAUCCUGGACUCUCCCGACCCCUAGCUGUCGGUCCCCCUCCCUGCG… 4424 nt 0.5190
NM_001676.7 NCBI
CUCAAUCCUGGACUCUCCCGACCCCUAGCUGUCGGUCCCCCUCCCUGCG… 4406 nt 0.5191
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the family of P-type cation transport ATPases. This gene encodes a catalytic subunit of the ouabain-sensitive H+/K+ -ATPase that catalyzes the hydrolysis of ATP coupled with the exchange of H(+) and K(+) ions across the plasma membrane. It is also responsible for potassium absorption in various tissues. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in rhesus macaques demonstrated that whole-thorax irradiation induced significant transcriptomic changes in lung tissue, where the ATP12A (ATP12A) was identified as the second most upregulated gene among common differentially expressed transcripts in irradiated animals compared to controls [Priyanka Thakur et al. DOI:10.1016/j.ijrobp.2021.03.058]. This upregulation was part of a molecular signature associated with radiation-induced lung injury, positioning the ATP12A as a potential biomarker for this pathological condition.