Basic Information

Symbol
RALGDS
RNA class
mRNA
Alias
Ral Guanine Nucleotide Dissociation Stimulator RalGEF RGF RGDS Ral Guanine Nucleotide Exchange Factor KIAA1308 RalGDS
Location (GRCh38)
9:133097719-133149334
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006266.4
Sequence length
3696.0 nt
GC content
0.5998

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1531.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1583.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 853.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001042368.3 NCBI
GGCGAGGCCCGAGCGGCCGGAGCGCGGCGCGGCGCAGACAAUGGGAGCG… 3675 nt 0.5992
NM_001271774.2 NCBI
GCUCAGAGGAGCAGGGCUGGGAGCGAGGUGCUGCUGGGGCAGUGUCUGG… 3597 nt 0.5908
NM_001271775.2 NCBI
ACUCCACUAGGGCACGCAGGCGACGAGCACACUGGCAGAGGGCCUCCCG… 3690 nt 0.5919
NM_001271776.2 NCBI
AGCGGUGGCAAAGCCCAGCCGCGCGGGCCGCGCCGCCGCCCCCGCCGCG… 3660 nt 0.5997
NM_006266.4 NCBI
AGCGGUGGCAAAGCCCAGCCGCGCGGGCCGCGCCGCCGCCCCCGCCGCG… 3696 nt 0.5998
Summary

Guanine nucleotide dissociation stimulators (GDSs, or exchange factors), such as RALGDS, are effectors of Ras-related GTPases (see MIM 190020) that participate in signaling for a variety of cellular processes.[supplied by OMIM, Nov 2010]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the RALGDS as a differentially expressed gene that was upregulated in animals with hypertrophic cardiomyopathy, where its expression pattern was better explained by a statistical model incorporating both disease condition and age rather than condition alone [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].