Basic Information

Symbol
RANBP9
RNA class
mRNA
Alias
RAN Binding Protein 9 RanBPM Ran Binding Protein In The Microtubule Organizing Center Ran-Binding Protein 9 Ran-Binding Protein M RanBP7 BPM-L BPM90 Novel Centrosomal Protein RanBPM Ran Binding Protein, Centrosomal RANBPM RanBP9
Location (GRCh38)
6:13621498-13712087
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005493.3
Sequence length
3384.0 nt
GC content
0.4965

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1108.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1169.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 884.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005493.3 NCBI
AAACAGCCGCGAGAGCAGCGGCCGCGGCGGCCGCCAGCGCGCCUUCCCC… 3384 nt 0.4965
Summary

This gene encodes a protein that binds RAN, a small GTP binding protein belonging to the RAS superfamily that is essential for the translocation of RNA and proteins through the nuclear pore complex. The protein encoded by this gene has also been shown to interact with several other proteins, including met proto-oncogene, homeodomain interacting protein kinase 2, androgen receptor, and cyclin-dependent kinase 11. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human prostate tissue demonstrated that the RANBP9 is upregulated in samples with a high postmortem interval (PMI > 3 days) compared to a low PMI group, identifying it as an mRNA marker for PMI estimation with a role in enzyme binding molecular functions [Javan et al. DOI:10.1038/s41598-025-29561-7].