Basic Information

Symbol
RASAL2
RNA class
mRNA
Alias
RAS Protein Activator Like 2 NGAP Ras GTPase-Activating Protein NGAP Ras Protein Activator Like 1 Ras GTPase Activating Protein-Like RAS Protein Activator-Like 2 RASAL2/ACVR1 Fusion
Location (GRCh38)
1:178093768-178484147
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_170692.4
Sequence length
9843.0 nt
GC content
0.4399

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2876.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3065.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2623.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004841.5 NCBI
AUUCCAAACUGUCUGAGGCACGAAAUGAGAGCAAAAAGGGAGAGAGCAG… 9176 nt 0.4187
NM_170692.4 NCBI
AGAGCCUGGUCUGACCGCGAGAGACGCCGGCGGGGCUGAAGAAGGCGGC… 9843 nt 0.4399
Summary

This gene encodes a protein that contains the GAP-related domain (GRD), a characteristic domain of GTPase-activating proteins (GAPs). GAPs function as activators of Ras superfamily of small GTPases. The protein encoded by this gene is able to complement the defective RasGAP function in a yeast system. Two alternatively spliced transcript variants of this gene encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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