Basic Information

Symbol
RASGRP3
RNA class
mRNA
Alias
RAS Guanyl Releasing Protein 3 GRP3 CalDAG-GEFIII KIAA0846 Calcium- And Diacylglycerol-Regulated Guanine Nucleotide Exchange Factor III Calcium And DAG-Regulated Guanine Nucleotide Exchange Factor III RAS Guanyl Releasing Protein 3 (Calcium And DAG-Regulated) Guanine Nucleotide Exchange Factor For Rap1 Ras Guanyl-Releasing Protein 3
Location (GRCh38)
2:33436272-33586669
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001139488.2
Sequence length
4386.0 nt
GC content
0.4161

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1200.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1284.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1020.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001139488.2 NCBI
ACUUGGCAGCUGGACAGGCAGAGUGCUGAUGUGAAAAAUACCACGACAA… 4386 nt 0.4161
NM_001349975.2 NCBI
AUUGAGCUCAAAGCUUAGCAGCUUCAAUGUUGUUGUUAGGCAUAAACAG… 4817 nt 0.4181
NM_001349976.2 NCBI
ACUUGGCAGCUGGACAGGCAGAGUGCUGAUGUGAAAAAUACCACGACAA… 4284 nt 0.4169
NM_001349977.2 NCBI
ACUUGGCAGCUGGACAGGCAGAGUGCUGAUGUGAAAAAUACCACGACAA… 4508 nt 0.4213
NM_001349978.2 NCBI
AUUGAGCUCAAAGCUUAGCAGCUUCAAUGUUGUUGUUAGGCAUAAACAG… 4692 nt 0.4130
NM_001349979.2 NCBI
GUCUAUCACAGGCAGCUAGGAACUGCUUGCCCACUUUUUUUUGUUCUGA… 4400 nt 0.4157
NM_001349980.2 NCBI
ACUUGGCAGCUGGACAGGCAGAGUGCUGAUGUGAAAAAUACCACGACAA… 4505 nt 0.4211
NM_001349981.2 NCBI
ACUUGGCAGCUGGACAGGCAGAGUGCUGAUGUGAAAAAUACCACGACAA… 4383 nt 0.4159
NM_015376.3 NCBI
GAUACCCUUUACACUAGAUUAGCAGGCAAAACUAUGAUGGUUUGUGAUA… 4336 nt 0.4147
NM_170672.3 NCBI
AUUGAGCUCAAAGCUUAGCAGCUUCAAUGUUGUUGUUAGGCAUAAACAG… 4695 nt 0.4132
Summary

The protein encoded by this gene is a guanine nucleotide exchange factor that activates the oncogenes HRAS and RAP1A. Defects in this gene have been associated with systemic lupus erythematosus and several cancers. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

A study in humans identified the RASGRP3 as a potential biomarker for early detection and diagnosis of cardiovascular disease in patients with type 2 diabetes mellitus, where it was found to be upregulated and associated with four SNPs in an mRNA-SNP-miRNA interaction network, affecting endothelial cell signal transduction in angiogenesis [Fan et al. DOI:10.1186/s12872-021-02166-4].