Basic Information

Symbol
RBM25
RNA class
mRNA
Alias
RNA Binding Motif Protein 25 FSAP94 NET52 Snu71 RNPC7 S164 Functional Spliceosome-Associated Protein 94 RNA-Binding Region (RNP1, RRM) Containing 7 RNA-Binding Region-Containing Protein 7 Arg/Glu/Asp-Rich Protein Of 120 KDa RNA-Binding Protein 25 RED120 U1 Small Nuclear Ribonucleoprotein 1SNRP Homolog Arg/Glu/Asp-Rich Protein, 120 KDa RNA-Binding Motif Protein 25 Protein S164
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_021239.3
Sequence length
6813.0 nt
GC content
0.3863

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1679.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1822.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1729.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((..((((..(((((((.((.((.......)).)))))))))(((((.(.((((((......((((((((((((..(.((((...((....))...)).)).)..)))..((((.((((..........)))).)))).((((((.(((((........)))))))))))(((((.(((.(((((((.((...((((((((.((.(((((...(((((.((((.............)))))))))..(((((..((((((....(((.((((.((((.(((.((((((.(.....).)))))).......((((......))))....(((.....((((.((.((((.(((.((((....))))..)))..)))).))))))..)))(((((..((((....)))).........))))).....(((((......)))))(((((((((...((((.((..((((..(((((...((((.....(((((....))))).....)))).....(((((.(((((....(.((((((...)))))).)....))))).)))))...((((((((.(...........)))))))))...(((((((((.(((..........)))..))))...))))).....))))).))))..)).))))..))))))))).))).)))).)))).)))))))))))..(((((....)))))...))).((.((((((.......(((((....)))))........)))))).))...........)))).).)))))))))).....(((((.(((..(((((......((....))......))))).))))))))......(((.(((..((((((.(((..............((((((...........))))))....((((((((((((..(((.((((....((((.(((((((((..((.((((((.....((((....)))).................(((((.((....)).)))))................(((((((..(((.((((((((......((((((((.(((((((((.((....(((((((((.((((((((..((.(((((((((((..(((((((((((....(((((((((((..((((......(...(((((((((.........(((((((.(..(((..((((...(............)...))))..)))..)............(((.(.(((.((((........)))).)))))))((((((.(...((((((...(((.(((((((.((..((.(((((................))))).....(((...((((((.((((..((((.((((((((.(.((((.(.((((((........((((..(((..(((((((((....((((....((((((.(((((..((((((((....((((((((..((....((..((((((((((.......(((....)))..........(((((.......(((.(((((.....))))).))).....)))))......................((((((...(((((.((((((((((..((.....................((((.......))))..(..((((........))))..).((((..((.((((.((((.(((((((...(((((((((.(((......(((((..((((((.((.((((((....((.....((((((.......(((.((.((((((((..((((((..((((((.....))))))..).((((((...))))))(((((........))))).......((((.(((...((((((((..(((..(((((((((((.((((((...((....))..........((((((...((((((...((((.((((((((((((....(((.....((((((.((((((((((((((.(((((....(((((................)))))......)))))))))).)))...)))))).))).)))(((((.............(((.((((((((((.....((.((.((....)).)).))......(((..(((............)))..)))..(((((......((((((((..........((((....)))).))))))))....))))).......((((((...........(((((((((((((((((....(((((((((..(((..((((...........((......))..)))).))))))))))))..(((....((.......))...))))))))))))))..((.((.......)).))..............((((...))))......))))))...........)))))))))))))))).))).(((((((...(((.((((((....))))))..)))...)))))))..((((........))))............((((((((((((((((...)))))..((((((((.(((((((.(((((((................((((((......)))))))))))))..))))..))).))))))))(((((....((((((((......))).)))))....)))))....(((((.....)))))..(.((((((..((((((........))))))..)))))).)..)))))))))))....((((((((((...(((...)))...)))))))))).))))).....)))....)))))))))))).)......)))...))))))..)))))).)))))).)))).))))))).)))))))..))))...))).))))..)))))..)))))))).)))))(((((..........))))).)))))).....))....)).)))))).)))))).)))))......))).))))).))))(((.((((((((((((((((..(((.((..(((.....)))..)).)))...))))))))...........)))))))).))).....(((((((((..........(((((..((((((....(((((..(((.....((((.(((....))))))).....)))..))..)))))))))..))))).(((((...(((.(((((((...(((((.(((.........))).)))))))))))).)))...)))))(((((.....)))))..........(((((((((((.............)))).)))))))..)))))))))...((((.(((...))).))))(((((((.(((.....)))..)))))))..(((((...((((.((((.(((((.((...)).))))).)))).))))..)))))..))))))).)))))))).))..))))))..)))))))))).)))))((((((...((((((...)))))))))))).......(((..((((....))))..))).........)))))).............)))))))))).))))..))))))))..((..((((((((((..((((((.((((..(......(((((.((((......))))..))))).........................(((........))).)..)))).)))))))))).))))))..))..........((((..(((((.......(((...((((((...(((((....)))))..))))))....)))))))).))))............))))))))..))))).)))))).....))))...)))))))))..))).))))...(((((((..((((((...(((((.(((((((((.(..(((((((((..((((((......))..))))..)).)))))))(((....)))((((....((.(((((((......))))))).)).....))))...............).))))))))))))))((((((((((..((((((...((.((.....(((((.........))))).....)).))))))))))))))))))......(((....)))))))))..))))))))))))).).)))).((((....).)))(((((.(((((......((((((((...........))))))))(((...))).....((((.((((((((.((((((....(((((.((...........(((((...)))))..((((((((..............)))))))).....(((((((((((..(((...)))...))))))))))))).))))))))))).)))))))).))))......)))))..)))))..).)))))))).))))...)))).).)))))...((((((((...(((((...((.....))..)))))...)))))))).((((......)))).....)))...))..)))))))))))).))))))....).))))))))))))).........))).))))))...)......)))).)))))))).....))).(((((....((((......)))))))))..))).))))))))....))))))))))))).)))).....)))).))).))))))..(((..(((.....(((.(((((((((((((((..((....(((((((((((((....(((...)))..))))))))((((((((((......))))))).)))..((((((((((((....))))))))))))((((((((((((((.(((.........((((((..(((((((((..((((((......((.....))))))))..))))))))))))))).((((((.......)))))).(((((.((((.(((((.((...(((((..((((((((((((((((((((........(((((((......))))))).............(((((((((((.(((((.....))))).)))))..))))))....((((((((.((((((....))))))((((((((((....((((((...((.((((......)))).))))))))((((((((((((((....)))))).)))))))))))))))))).......((((..((..(((((((.(((.((((((...))).)))))).)))))))..))..))))(((((...((((.....))))...))))).....(((((.(((....)))))))).))))))))((((((.(......).)))))).)))))))))))))).............(((((((((((((..((((((((((((.((((..(.((((....)))).).......(((((((((((.....)).)))).......))))))))))))....)))))))))))).))))).))))).....((((.......))))...((((((((((...))))))))))((((((((........))))))))((((((..((((((....((((.(((((((....((((((((..........))))))))....)))((...........))((((((....(((.((((.((..((((((.((.(((((.....))))).)).(((..((((((.((((.......))))..)))).))..)))..((((((.((((.....)))))))))).))))))..)).))))))))))))).)))).)))))))))).)))))).)))))))))))((((((((((((.....))))))).)))))((((..(((...((((....((((.((........)).))))....)))).)))..))))..(((((((((.((......)))))))))))..)).))))).)))).))))))))))))))).)))))))..............)))))))..))))))))))))))))))..(((((((.(((((........(((((...(.((((((.....)))))).)...)))))........)))))..))))))).......((((........))))...))).)))...............)).))))))))).))))))))...((((......(((.((......((.((((((.........)))))).))...)))))..))))...))))))))..))).)))))))))))))))..(((((((.((.((((((((((((((((((...((((...))))...))))))))).)).........))))))).))....))))))).((((((((....))).)))))....)).))))))))))).)))).)))...))))))))))))....)))..))))))))).)))......)).)))))..)).))).)))))...........)))))))))..........)))))).))))))....................))))((((((......))))))..................((((((...((((((..(((((.....((((((((((.((((((((.....((((....))))..........))))))))))))......)))))))))))..))))))....)))))).......))))..))))..........(((...(((((.(((((.((..........)).))))).)))))..))).(((((((((...)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(((({.({({{{(((((((.((.((.......)).)))))))))(((,{{(.((((((......((((((((((((..(.{({(,..{{....})...)).)}.)..))).,((((.(((({{...,},..)))).)))).{(((((.(((((......}.))))))))))|{({{{.{((,{{((((((((.,{(({((({..{{.{{{((,,.((((,,((((.............)))))))),..,,,{{.,{(((((,,..{((.((({.((({.(((.((((({.,.....}.}))))).......{(((,,,.,{||||{({((((,.{{.((((.((.((((.{((.((((....))))..)))..)))).)))))}.}||,{({{{{((((((..,{{{{.........{((((((((.(((((......))))).)))))))}}{,{..{,{((((({(,{((({{{.....(((({.{{{{,,..,||}}|{{{{,||,,,|}||||||,.|||{||...{.|{{{{{...))))))})}},,))))).))))),..{|||{{||.|,}|....,},})))}))))}...(((((((((.(((..........)))..))))...))))).}....,}||,,|||{{..,||||.{||...,.,..}}),)))),)})),))})))}))))..{{{{{...,)))))..)))))||,{{{{||,......(((((....)))))......,,)))))),)),,.........}}}|.|{||||||||,,....,(((({,(((..(((((......{,,,..,},,,,},))))).)))))))),}....,,.}}||}}||||}.||.,.}}.,,,,..,,..))}}}}}..||||},..,}))}}....((((((((((((..(((.((((....((((.((((((({{..((.((((((.....((({....})))............,,,..((((,.((,...}}.}))))....,}}.........(((((((..(((.((((((((...{{.,,,..,,...........,,,...,{{{{,.{{{{{.(((((((((((((.(({,..{{(...,,,,.}}}......((.{..,.((((...((({,(((....{.((((((({.,.....{((((((({,,((((.((.(((..((({((((........))))...{(({({,,..,,,,,..{{{.{.(((.((((........)))).))),}||{{{{{{..{{{,.((.((((((........((((.((((...((,{(((((..{((((((((((.....{(((..((.({((((((..,,(((((((((((((,.(,((((.((.((((((((.((({((({{{((.((((((.((((((((((((((((((({{{({(({{,,{{{..,,,,,{{.{,.{({{{{{,({(((((((,{{(({........((({,,.,,{{{.,,,{{{{(((,.{{,.{{{{{(,{((((.....))))),}}}.....{(((({{{(({{,........,....,,|{{.....|,,{,.,...,{({,,,{{{,,,..,{{{,.((((((((,(({{({,,{{{,.,,......,,,,..,..,,})),}...,,{(((((..(((.((((((((((((({(((((((((((({,{{.{|||{{,,...{(({,(.((..,((((((((((((({...,,,((((((((.(((((.((,,(({,{((({({({,((((((.....)))))).{|.||||||.,,|}|||}||..........{(((((((..((((((((((((........,...(((((((..((((((((((((((..((({{((((.(((((((((..(((.,,..,,{{,.{{.({,,...............,,{..{,,{({{{((,((((((((((((({,(((((....((((({...,.........,.)))))......)))))))))).)))...)))))),||,.,)),.......((((,{,...(((.((((((.(((.(((.{(.(((((((((((((((((......(((..(((............)))..)))..(((((......(((((((({{{,,,....||||.,,,}}},.))))))))....))))).,(((....}))}(((((.((((......,.)))).)))))........))))))........)))))),.})))).}}.....))).))).))))))..)))}},.)))).(((((((.....(((((((((,((...,((..((.((.......}}.}}..}}}......,,,((((...)))}.,{{{{{.,,{(((((.(((((((.....)))))......)).))))}||..,),))}}|,((({{..,.(|((({.(((((((((....(((({{,.{(((((,(((((.....,,,.((((((((((((((({...}})},..((((((((.(((,{((,(((((((.{{{.{{((......)}}|,,,.....,}))),.)))))),.,))),..))).)))))))){{((((((({(((({((......))).))))).))}))))}..,,(((((.....))))}}}|.((((((..((((((........))))))..)))))).,.})))))))))))...,({{{((((((...(({...|})...)))))))))),,,..}.},},}},,,.,,}||||,....,,,}}}|||})))}.)))))))))))))))))))).)))).),..))))}..,)})))))))))..)))))))...,})})),))}))))}...|,,(((((..........)))))..}}......{((....))).|||....)}}))).))))))....))).)))))))).)))))}.((((((.((((..((((,....(((((.......((((,...||||.,,,,.,,||,,,|||,}}}},..(((({..,...,..|{{|,,,,}}}}......(((((..((((((....(((,{,,(((.....((((.(((....))))))).....)))..))..)))))))))..))))).(((((...((,.(((((((...(((((.(((.,.....,.))).)))))))))))).,))...)))))...((({(..(((((((.((((({.(((((((((((.............)))),}))))))....}))))}....))))))).)).))))))))(((((((.,({.....}}}..)))))))..(((((...((((.((({.(((((.((...)).))))).,))).))))..)))))}.}))))))))..)))).)))))).))))))))..))))))).,|.(((((((...((((({...})))))))))))).,,......{(((((....)))},)}}))))).......))))))..)))))))}..{(((....)))},,....,,}))))..)}}..}))).)).))))))))))))}.........(((((.((((......))))..))))).....{{{{{...((((.((({{{{{((((((..(({{{((((((((((.{.{,,{({.{({{{{((({{....}}.}}}|.}}})))}),.,))))))))..{(((((.,.{((({....))))}.,)))))}.......||.,,,}}}}.....,},,}}}))),.)))))))))))).)))).}||||{{{{{((..{(((((.,({{(((((((((((({........}))))))))).(((((((((.(.,(((((((((..{{({{{......)}..})))..)).}}}||}}{{,....,,}|{{{....({.(((((({......})))))).}}.....,}}}..,....,}},,.,.}.))))))))).............((((........))))}}}}}..})))))..}}))))))))),,...,}.}}))))))))))))))},.)).)))))||,|||{||{..,{....,,.}})))}}.,)},,((((((....).))))).....)))}}})))}((((((((...........))))))))...)))))..)))).)))).)))..)))))),...,{{{{(((.(((((({.{{{{{,{.((({.,,,}}}}.|..|||},..}}}))),,,}..,},,}},.,,,.(((((((((((.{(({...}}}.,,)))))))))))...)))))))|{{{{.,,.((((((..,.....,,.)))))),)).,))})))))))).))))...})))}}))))))},}}||,,.|}}},|,,,{,,,{|..,,.},..)))))}},..)))))),})}))}}}}}|({{{{,.......{{|..|{,,,,,))}.,)),}},,..)})})))})))))))))......{|||,{|{,,,,|{{{|.||{{.||||{|||||,,,...,}}},}}.,,.,|.}}}}..)))}}..))))))).,,}..}))).,))))))))))))))))).)))))).))..,{{,,{...,{,..{{|(((({{{({.....((((((((((......))))....)))))).((((((((....{{{...)}}..)))))))){{((((((((......)))))))}|}|.(((((((((((((....)))))))))))))...},,{(((.,{|}}|,((((..((((((((,.{((((((((..((((((......{{.....)}))))))..))))))))))))))},))..)))).,...,})}),}))},.,,,})}},|}}}||{}|||{|,,{{({{{{{......{{{(((((.((((,.(((((((......)))))))............{({..,,||},,.{(({{...,,}}}}|((((({.........}}})}}.,,},,}|,}}}}})))))))),.......)))))))).}},,.})})})))),.(((((.(((.((.....)).))).))))).})),)))))))).)),)))).,..))))))))))))|(((..((..(((((((.(((.((((({...})).)))))).)))))))..))..)))}.,,....)))))}))).)}..))))...))).)))))))}...))))))))...)))).)))).((((((.{......).))))))(((((............))))).{((((((((((((((((,.{(((((((((,(({((({..,.((((.....|((((.......|||||((((((.....)).)))),.....,)))}))))),})}}..)))))))))))).))))).)))))........)))))))))))))...{((((((((...)))))))))))))).)))))))}...........((((((..((((((....((((.((({(((....((((((((..........))))))))....))){{.........,,}}((((((....{,{{((((.((.,((((((.((.(((((.....))))).)).(((..((((((.((((.......))))..)))).))..)))..((((({,((({.....)))))))))).))))))..)).))))))))))))).}))).)))))))))).))))))..{{{..{.{{{((((((((((((.....))))))).)))))...,,}},,|.,}}}...........|||{.{,{{(({{({{{....))),..,)))))))))}|(((((({((......))))))))}))))..))).))))))....))))))))........,}))))))).)..))).))))...)))).}}.).)).,))))))....(((((((.(((((..,.....(((((.,.(.((((((....,)))))).}.,.)))))........)))))..))))))).......,,,,.......|||||,||.,,,.,...}}}.,,}},,,,.)}.))))))))))))))))))..,.........,,...,{...,..((.((((((......,..)))))).}}...,))),})))))...))))))))..))).)))))))))))))))..,{(((((,((.,{{{{{{,.(((((((((...((({...})))...))))))))),))},...,.,,||}}|||.}}...,)}})))}.{(((({{(....})).))))}....)).))))))))))).)))).)))...))))))))))))....|||,||}}},.,},,,})).{|{{||{,,,,...,,}))).)))||,.....,....))))))))}..........)))))).}}}}}|.........,,,,,,.{{|||||}((((((......))))))..........,,,,|,,,,}}||||,|||||||,,{{{{...}}}},..,,|,}},|{{|||||.,,,.((({....})))...,,,,,,,}})))}))},,,.{((((.{(((((.((....)).)))))))))))......},))))..))))..........(((...(((((.{((({.{{..........}}.}}})),))))}..))).{((((((({...})))))))}

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGACCUCCAUCAGCUCGCCGCGCAGCGCGGCUGUAUUUGCGGCCUGUGC… 6813 nt 0.3863
Summary

Enables mRNA binding activity. Involved in regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome and regulation of apoptotic process. Located in nuclear speck. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the host gene RBM25 produced 11 circular RNA species across specific peripheral blood mononuclear cell subsets in critically ill patients with sepsis due to community-acquired pneumonia [Khan et al. DOI:10.1186/s13054-020-03146-4].