Basic Information
Symbol
REEP5
RNA class
mRNA
Alias
Receptor Accessory Protein 5
DP1
TB2
Polyposis Locus Protein 1
C5orf18
D5S346
Yip2e
POB16
Polyposis Coli Region Hypothetical Protein DP1
Receptor Expression-Enhancing Protein 5
Deleted In Polyposis 1
Chromosome 5 Open Reading Frame 18
Protein TB2
YOP1
Location (GRCh38)
5:112876385-112922328
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
MANE select
Transcript ID
NM_005669.5
Sequence length
3008.0 nt
GC content
0.3826
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-744.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-805.24 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
601.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACUAGGAACAGCCCCGAGCGGCGAGACGGUCCCCGCCAUGUCUGCGGCC… | 3008 nt | 0.3826 |
Summary
Predicted to be involved in endoplasmic reticulum membrane organization and regulation of intracellular transport. Located in endoplasmic reticulum tubular network. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]
Forensic Context
A study in humans identified the REEP5 as a housekeeping gene with highly uniform and strong expression across 16 normal tissues, proposing it for calibration in biotechnological applications [Eisenberg & Levanon DOI:10.1016/j.tig.2013.05.010]. Subsequent research in mice with sepsis found that the mRNA expression level of the REEP5 did not show a significant difference between cecal ligation and puncture and sham control groups [Yang et al. DOI:10.1038/s41598-025-06463-2]. A study in rats demonstrated that the REEP5 was differentially expressed in the hypothalamus during hypothermia, with 18 tags in control samples versus 4 tags in hypothermic samples, indicating its downregulation in the hypothermic state [Takamiya et al. DOI:10.1016/J.Jflm.2012.04.017]. In a separate human study, the REEP5 was identified as a housekeeping gene with highly uniform and strong expression across 16 normal tissues, leading to its proposal as a calibration control for genomic studies [Eisenberg and Levanon DOI:10.1016/j.tig.2013.05.010].