Basic Information

Symbol
RELL2
RNA class
mRNA
Alias
RELT Like 2 C5orf16 RELT-Like Protein 2 FLJ90583 Receptor Expressed In Lymphoid Tissues Like 2 Chromosome 5 Open Reading Frame 16 RELT-Like 2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_173828.5
Sequence length
2536.0 nt
GC content
0.6483

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1195.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1233.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 516.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((((((.((((((....)))...((.((((((((.......((((...(((((.((((.....)))).)))))))))(((((((((.((..............(((((((((.....))).)))))).(((((....(((...(((...)))..)))....)))))(((((.(((...))).)))))..)))))))))))...(((((((((......((((((((........))))))))..))))))))))))))))).))((((((..((((........((((.......)))).))))..))))))..))).)))))).(((((((((.(((((((..(((((.(((((....))))).)))))...))).))))(((((....)))))......((((....))))..((((((((((((((((.(((((...)))))...(((.((((((....(((((.((.(((....))).)).))))).)))))))))...(((((((((((((((((....(((((((....((((((((((((((((((.(((((.(((.(((((((((..(((((((....)))).)))...((((((.(((((((((((..(....((((.((.(....(((....)))...).)).....(((.((((((((((((........))))..)))))))).)))....))))....)..)))((........))...)))))))).)))))).)).)))))))...))).))))).))).......)))))))))))))))....))))))).(((((((((((((((((((...)))))((((((.....(((((((((.((.((.((......))..)).)).)))).)))))....)))))).((((....((((((..(((....((((((((.....(((........))).....((((.(((((...))))).((.((.(((((.(((((((.(((((((.(......).))))))).......(((((....)))))....((.(((((((...((...((((.((((.((((..(((((((((((((..(((((...(((..(((.(((((....))))).))))))))))).))))...)))))))))..))))...))))..).)))..)).....)))))))))))))))))))))..)).)))))).((..(.((.(((((.........))))).)))..))((((......)))).......(((((((((((..(.((((((((((((((((..((((((((((((((((((..((((.(((((.((((.(.....(((((...((((..(((((((...(((((...))))))))).))).))))...)))))).)))).))).)).)).))....(((....((((.(((.....))).))))....)))...))))))))..)))).)))))).....)))..((((.....))))))))))))..(((((((...)))))))((.((((...)))))))))))).)))))).))))).))))))))....))).))))))...))))))))))))))))))(((((..((((....))))...)))))((((.((((((((...(((..(((((......)))....))..))).))))))))))))..(((.(......).))))))))))))))))))))..............(((((......((((.....)))))))))((((((((...(((.(((....))))))))))))))))))).)))))))))))....)))))))))(((((((((.(((.((((((....)))))).)))..(((((((.(((((((.(((....)))...(((....)))...((.(((........))).)).)))))))...)))))))..(((.(((......))).))).....((((...))))(((........))).(((((...((.((((((((..((....(((((((((.............)))))))))..)).....((((((..(((.....)))))))))..(((((..((.((((((((((((((((.....)))).))))))..(((....)))((.(((((((((((((((.(((.((((......)))).))))))).))))..........(((((((((..(((((((((((((........))))))))....))))).)))))))))....((((((((..((.........))..))))))))..))))))).))....(((.....)))..((((.(((((...((.(((((.........))))).))....)))).).)))))))))))))))))))))))))...((....)).))...))))).)))))))))..((((..((((((.((((....)))))))))).))))..((((((.......))))))..))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..((((((.(((((({...(((((.((..{((((((.......((((,..,((((.((((.....)))).)))))))))(((((((((.((..............(((((((((.....))).)))))).(((((....(((...(((...)))..)))....)))))(((((.(((...))).)))))..)))))))))))...(((((((((......((((((((........))))))))..)))))))))))))))))}))}}|{{(..((((........((((.......)))),))))..)})))),))}..)))))).(((((((((.(((({{{..{((((.(((((....))))).)))))...))),|||,(((((....))))).}}}..{({{....)))),.((((((((((((((((.(((((...)))))...(((.((((((....(((((.((.(((....))).)).))))).)))))))))...(((((((((((((((({..,.(((((((....(((((((((((((((.(((((((({((({(((((,(((.,(((((((....)))).))}...|{(||,.|||||||,}}|}}|}..}}}}}}}}}}}},.{((....}}),.{((((.....))))}|,,,,((((((,.{{{{.{|,||.{|||||||{.|||{{..,|||.,,.,..})})}..,,,|..||...}},}}))).)}))),}),))))))))}}})))}||,,....)}....,.)))))))))))))))....))))))),(((((((((((((({(({(,..}}||}{(((((.....(((((((((.,{.{,.,|.|{{,{},..})}))}))))}}))))....)))))}.{({{..,,((((({..{((,,,,((((((((,,,..||||||....,|||{{..,((((..,((({{{{|||,,((({..(((((.(((((((((((((({.(......}.)))))))|,.,,,.(((((....)))))..,,{|.(((((((...((...(({..{{((.((((..(((((((((((((..((((({..({{,{(({.{||||,...}))}}.})}}})))))).))))...))))))))).,)))}...)))),,}.}}},.||,....))))))))))))))))))))).})}|}}}}}},}|}}.{((.(((((.........))))).)))....((((......)))).......(((((((((((..{.((((({(((((((((({.((((((((((((((((((..((((.(((((.((((.(.....(((((...((((..(((((((,..(((((...))))))))).))).))))...)))))},)))).))).)).,|.|,.,,,{{{..,,(({{.{{{..,,,))).))}),}}.}})}}}))))))))..}))).))))))}},,)))}..((((.....)))),,})))))..(((((((...))))))){(.((((...)))))))))))}.)))))).))))).))))))))....}}}.)})))).,.}))}))))))))))))))(((((..((((....}}}),,,)))))((((.((((((((...(((..(((((......))}...,))..))).)))))))))))).,(((.{......}.)))))))))))))))))))).,............(((((......((((.....)))))))))((((((((...({{((((....)))))))))))))))))))}}})))))))))....)))))))))(((((((((.(((.((((((....)))))).)))..(((((((.(((((((.(((....|||...|||....)))...{(,(((........))).)).)))))))...)))))))..,(({(((......))}.))).....{{(,,,,|}}}{{|,},.....})}.(((((...((.((((((((..((....(((((((((.,...........)))))))))..)).....((((((,.{((.....)))))))))..{((((.,((.((((((((((((((((.....}})},.}))))..{((....))}((.(((((((((((((((.(((.((((......)))).))))))).))))........({(((((((((..(((((((((((((........))))))))....))))).)))))))))}...((((((((..((.........))..))))))))..))))))).))....{{{..|||)}},,((((.(((((...((.(((((.........))))).))..}.)))).).)))))))))))))))))))))))))...((....)).))...))))).)))))))))..((((..(((({((((((....)))))))))).))))..{{((({.......}))))}..))))).........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAGCGUCCCGGGUUGGGCAGGGAACUGGCAGCAUAGCUCCUAGGAUGCG… 2108 nt 0.6490
GAGCGUCCCGGGUUGGGCAGGGAACUGGCAGCAUAGCUCCUAGGAUGCG… 2536 nt 0.6483
Summary

Predicted to enable collagen binding activity. Involved in positive regulation of p38MAPK cascade. Predicted to be located in basement membrane and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.