Basic Information

Symbol
RELN
RNA class
mRNA
Alias
Reelin PRO1598 RL EC 3.4.21.- EC 3.4.21 ETL7 LIS2
Location (GRCh38)
7:103471381-103989658
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005045.4
Sequence length
11708.0 nt
GC content
0.4736

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3731.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3954.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3019.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005045.4 NCBI
CCAGGCCUGGCCGAGGGGCGUCGCGCAGAGGCGGCGGCGGCGCACGGAG… 11708 nt 0.4736
NM_173054.3 NCBI
CCAGGCCUGGCCGAGGGGCGUCGCGCAGAGGCGGCGGCGGCGCACGGAG… 11702 nt 0.4737
Summary

This gene encodes a large secreted extracellular matrix protein thought to control cell-cell interactions critical for cell positioning and neuronal migration during brain development. This protein may be involved in schizophrenia, autism, bipolar disorder, major depression and in migration defects associated with temporal lobe epilepsy. Mutations of this gene are associated with autosomal recessive lissencephaly with cerebellar hypoplasia. Two transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. Other transcript variants have been described but their full length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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