Basic Information

Symbol
RGL1
RNA class
mRNA
Alias
Ral Guanine Nucleotide Dissociation Stimulator Like 1 RGL Ral Guanine Nucleotide Dissociation Stimulator-Like 1 RalGDS-Like 1 KIAA0959
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference

MANE select

Transcript ID
NM_001297671.3
Sequence length
4725.0 nt
GC content
0.4646

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1482.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1564.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1385.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((..(((((.(((....))))))))..)))).((.((((((((((((((((.(((((((..((((...(((....)))..))))..))))))).))........))))))).)))))))))(((((.((.((((((........))))))..))..)))))...((((.((..(((....(((.((((((.(((....((((((.(((((......(((((((...((((((.(.......).))))))...))))))).....))))).)).))))...)))))))))..(((((.((((...((.((.(((((((((..(((.((((((.((((((.(((..((((((...((((...((((......))))..))))...))))))..(((.(((((((.((((((....((((((((.....(((....)))...((((((((...((((..(((((((((.........(((((...)))))......((.(((......))).))(((...(((((......)))))...)))(((.....(((((.(((((((((((...(.((((((..........)))))).).((((.((....))))))......((((...(((((....(((.(.....).))).....)))))))))((((((..((((((.(.((((((((((((((((((.....))))))).))(((......)))...(((((((........))))))).))))))))).))))))))))))).............))))))).......)))).)))))...))).)))))))))....)))).)))))))).))))))))..)))))).)))))))..))).......(((((.....))).)).((((((..((((((((((...)))..((((((......))))))..(((((((.(((((((((...((((((((((((((((........((((((((((((((...(((.((((((((...........((((((...((((((((((((((.(((((((((((((....(((.......((..(((.((((.....((((.(((..(((......)))..))))))).....).))))))..))....(((((((((.(.........(((((((...(((((((((.((..................)).))))))))).((((....))))((((((..((((((((((.....))))))))))..................))))))....)))))))........).)))).))))).((((((((...(((((.(((.((((((((.((((.....((.............((((((((.((((.(((.(((((.(((((..((.(..((((((...((((((.....)))))).))))))..).))....)))))...........))))).))).....((((((((((((...........(((...((((((.(((...((((.((((..((.........))..)))).((((((.(((((......))))).)....))))).............(((((((((((.((((..(((((((..(...)..)).))))).)))))))((((((.((((((((((((..(((((..((..(((((.(((..((.......))..)))..)))))..).)..)))))...)))))))...))))).))))))(((((((.....(((((.(....(.((((..........))))).).)))))..))))))).......(((((.(.(((.(......)))))))))))))))))).(.(((.((((((((((((.........((.((....)).))..((((..........))))...)))))))))))).))).).......(((((...)))))............(((((.....)))))..)))).))).))))))...))).((((((..(((.........................)))..))).)))))))))..))))))))))))))))))(((((.......))))).......(((((((.....((((((....)))))).........((.(((((((...........))))))).)).((((.((((((......((((.((((((((..((..(((....)))...((((....))))..((.((((((.(.((..((....))..))).)))))).))((((.....))))((((((((((.((.......((((((.(((........((.(((((((.......))))))).)))))))))))...((((((..((((.((((((.((((((((((...(((((((.((.(((((..((.(((.(((..(((((((((((.((.....))............((((((....)))))).)))))))))))))).)))))...))))).)).)))))).).....))))))((((((....))))))..((((((.((...)).))))))........))))...))))))..))))))))))(((((((.(.(((((((((........(((((((.(((((((.......(((((..(((((.(((((......)).))))))))..(((....)))........(((((........................((((((((((((.....))))))))))))...((((((((((...(((.(((.((((.((..(((((....)))))..............((......))((((.(....((((.(((((((((((((............(((((...((....((((.......)))).....))..)))))))))....))))))))).))))..).)))).....)).)))))))...)))))))))))))..(((((((.....)))))))....(((((....(((((.....((...(((((((.((((...(((((.((((.(((...(((((.(((....))))))))..))))))).))))).)))).))))))).)).))))).)))))))))).......(((..(((((((((((((..((.((((((.........))))))..))....((((((((....))))))))))))))(((((........)))))..)))))))..))))))))))))))).)))))))..........)))))))))).)))))))......(((((.....((((((.....((((...(((.(.((((..((((((((((......((((........))))......))))))).))).))))))))))))))))))....)))))........)).))))))))))....))..)))))))).)))).....)))))).)).))...........)))))))))...))))))))))...)).))).)))))...)))))))).((((...((....))..))))..........)))....)))))))))..)))).....))))))))))).))).....................((((....))))......))))))..)))))))))))..............(((((((((.(..((((((.(((((((.......((((((...................)))))).((((((.((..((((...(((.(((((((.((((....)))).))..)))))(((.(((((((...((....))...))).)))).)))(((((.......)))))((((.....)))))))..))))..))))))))....)))))))...))))))..).))))))))).........((.(((.((((((.....................)))))).))).))..)))))))....))))))).))))))))))).))))).........((((((.((((..((((((((((((((.((.......)).))))))))))))))((((((((((((((..(..((((((..((((((..(((.(((.....))).)))....))).(((((((((((..((.....))))))))))))).((((...)))).....(((((((.......)))))))....)))...)).))))....)..))))))........))))))))..)))).)))))).)).)))))))...))))))).....((((((((.((.......)).))))))))(((((((((((((((.(((.....................))).)))((((......)))).....)))))))).))))..)))))))))))))......((((((((((((.((((((((((((.......)))))))).)))).))).))))))))).................(((((..((((...)))).(.((((((...)))))).)....((((((.......))))))))))).....))).)))))).)).))))..)))....))))))))).)).))...)))))))))..)))....)))..)).)))).((((((((((((((((......)))))))).......((((((.....))))))..)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.((((..(((((.(((....))))))))..)))).{({(((((((((({(((((,(({({({((((,({,.{((,..{||}{{||,,.))))}))).}),,..}}},))})))},}}}}}}}}}{{{{{.((.((((((........)))))).,)).,|}}|}.,.((((.((..(((....(((.((((({{(((....((((((.(((((......(((((((...((((((,(......,).))))))...))))))).....))))).)).))))...)))))))))..,(((({((((...((.((.(((((((((.,(((.((((((.((((((.(((..((((((...((((...((((......))))..))))...)))))).,((({((((((({{(((((,...{{{||.||}}}||||(((,{{{{{,............,{{{((((((((((,,{{.((,,,(((((...))))),||,,,,}}))))||||...(((((.(((.(((((((((.{(((((.,,,{......||,|{{,{,{((((((..,.....)))})){{{.{(((,{,.((((((((((((.(({,,,||||||.......{|{{.(((((.((((((((.({.{{.,.(((((({{{(((((((..((((((({({{{.{.((((((((((((((((((.....))))))).))(((......)))...(((((((........))))))).))))))))).}}||||,|{(((((....,,....((((((((.......{{......}}....(((((((((((.((((...((((((,(((((((..(((((..{(.(((((((((((({,{.(((((((((((.((((.{{.,,....,||..((((.(((,{....},.}||,|||}.,,..)))))).((((((((.(((((((((((((((((..{.((((...(({....}))..)))).}.)))),,,....|,,...((((((...,((((((.......(((({...}))))..((((((((((({........,{,,.((..(((.(((,.....((({{(((..(((......)))..))))))).|.,.}.))))))..)}.,,},,(({({{{||||(,,..{.{{{{|||{((((,((((,.{(((.((.((((((......{{.,((.(((((..((((....)))),|,,,{..((((((((((,...,))))))))))...,{{{,...........,)))),.))))),))..}))))))))).)))}||..,,,{......||,....||||}}.}}}}))}.........}}}},,))}..,,,.})}).))}}|}}}.{{{,,.,||}(((((..((.(..((((((...((((((.....)))))).))))))..}.))....)))))|}},,...)))))))))))}.......)))))))))))))....))))))),...((((..((((..{((..((((,.,,.{{(.,..{((({({...{,(((({(,|...{(((((((.((((.............}.)))).)))))))}.,,{}||||}}..(((((.....)))))))))))).}},,))){(((((.((((((((((((..(((((..((..(((((.(((..((.......))..)))..)))))..).)..)))))...)))))))...))))).)))))))))}}}})))).)))).,)))))..)))))))}......)))))},))))).}))))).)}}}))))))).))))),.({(.,....},)))((((......)))).((((((.(..((((.(((((.......)))))...))))..}.)))))).......))))))),..))))))...)))).))))))).)))}......((((({..{((((.{((({,{{..{{{{,.........,((((..((,(({.((((..(((({.......{({{.,,{{(.,.{((((...(((..(((((......}))))..))).)})}|,{,,,(((((.......})))).,,{.,{....||{|||..((((({....)))))).........((.(((((((...........))))))).)).,({{({.......||{{|||{{(,((((((..{...(((....))),..)))))}.|||,...((.{{{{||.{,{{,,{{,,,,)).})}).}}}}}),)),{{,...,{||||..{{{{{{{{{{{{.{,{{{(((,{,.(((..,{,...(({((((((,,{{{{{,|}|}|},,|||||,,,,},{{,...||}},..,)))))....,}}}|||((({,,{((((((,{{,(((((..({.((({,.,..(((((((((((.||...................((((((....)))))).))))))))))).,,||||||...))))),)),)))))).}...),)))))}((((((....}))})).}|}))}}.}}}}}},}}}}}))},,,,}}}}}})}}}}}}.}}}})}|((({(,((((((...}}|,,|},|}}})})),)}})))|,,))}}|,,{{{{{{.,.{{{,....,,||}...,})))}|||||||||||||,{{{,,.,}}},...,,}})}}}..,,..,............{((((.((((((((((((.....)))))))))))).))))}.........,..}}}))}.}}}.}))){((({....)))))|...........}))))..))))...))).,)..)))).,....{{{{{.,({,,,{(...{,.{{{(,.....})))})),..},}))),,))))}.)))),)),))))))))}}.,,,.)))))).{((((.......})))})))))))}..{(((((....)))))|((((((.....))))))}......{{.....,,|||..........(((((((.((((...(((((.((((.{((...(((((.(((....))))))))..))})))).))))).)))).))))))).}},)},,})))))))}))}}...,.}))))))..))).)).)))))))))).,,.}}}}..)))))))).))))}...((((((((....)))))))).))}}((((((........)))))){(((((((......|,|,,,....|{{{{........})}}).,,.,,,..{((((((.((({.{((...))).))))))))))).)))))))}.|,|||}|,,...(({{((((((......((((........))))..,...))))))).)))})))),))),))))))))).}}}(((((({....))))))).)))),))}..,,(((((((((.....(((((((({...,,.,{{{{,...,,,|,{{{||,{{||||,.,}}},,.}}}.,},,}}},|||||{.....}))))).,||||.{{{{.|||{.{{|||,||,,,{{{{{{..{.,((((,|,|{,|,,,,,,..{((((....))))).....,..............,,((((....)))).,,...),))))..}..))))))))))).}}}}..}})},,,}}}|,,,}..})))))))).....)))))))))..................,,,)))))).)))))))))}}}.,,))))}||,,{{{{{{(.((({....}))).}|..}}}},(((.(((((((...{{....}}...))).)))).)))(((((.......))))),,{{{(,((,,,,,,||,}|||{,{{||}||}|||,||||,,...,|,,}}},.,|}}}}},))))....,,,,,|}||,.||||||,........,,,..,,...,,))))}}.|||{|||{|{||{.{(((.({|{({{{{{,,....|,,{{{{{({,...{(((((......}))))}||||||||{{{{,.{{..,,}}})).))))|,}}))))))|{{{{{{{{{((({{{({.,{{{{({{({{(((..,({.{{(.....||||}}||,,,}}),((((((((((,.,((.....))))))))))))).((({...}))).....(((((((.......)))))))...,||},,}}}},}))}}}},..))),)),,}}}}}}))))))))}}))))}.))))))))})}}|,,{{{{(({(((((({..((((((((.((.......)).)))))))).,,.,,{{{{{{{,{,{||.....................|||.}},}||})},})))))).}}.)))))..},,,.....)))))}))))}}}}}.,,,{(((((((((((.((((((((((((.......)))))))).)))).))))))}))))))......,..{{{,...,|||{,..{(({...)))).|.((((({...}))))).}....,,,,{,,},,.,.,}}}})}}}}},,,..))).)))))).)).))))..)))..,.))))))))).)).))...))))))))),,)))..,.)))..)).)))).((|||||||{{(((((......)))))}||,.,,{(((,(((,...}})))))).})))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGAUUGGCGGGGAUGGGCAGCAGCGGCAGGUGGCCUUGGCUUUUGCUGC… 5076 nt 0.4643
AGAUUGGCGGGGAUGGGCAGCAGCGGCAGGUGGCCUUGGCUUUUGCUGC… 4966 nt 0.4650
GUGGCCCGAGUCGCGCGCACCGGCGGCGGCGGGGGCAGCGCGGCGCGUG… 4725 nt 0.4646
GUGGCCCGAGUCGCGCGCACCGGCGGCGGCGGGGGCAGCGCGGCGCGUG… 4638 nt 0.4625
AGAUUGGCGGGGAUGGGCAGCAGCGGCAGGUGGCCUUGGCUUUUGCUGC… 5077 nt 0.4658
Summary

Predicted to enable guanyl-nucleotide exchange factor activity. Predicted to be involved in Ras protein signal transduction. Predicted to be located in cytosol. Predicted to be active in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the RGL1 transcript, a cancer-associated signalling protein, increased in abundance postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].