Basic Information

Symbol
RGS16
RNA class
mRNA
Alias
Regulator Of G Protein Signaling 16 RGS-R Regulator Of G-Protein Signaling 16 A28-RGS14 Retinally Abundant Regulator Of G-Protein Signaling Regulator Of G-Protein Signalling 16 Retinal-Specific RGS A28-RGS14P HRGS-R RGSR
Location (GRCh38)
1:182598623-182604394
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002928.4
Sequence length
2408.0 nt
GC content
0.5316

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-890.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -929.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 643.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002928.4 NCBI
GCUUGCAGGCUGCUAAACCCAACCGCAGUUGACUAGCACCUGCUACCGC… 2408 nt 0.5316
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the 'regulator of G protein signaling' family. It inhibits signal transduction by increasing the GTPase activity of G protein alpha subunits. It also may play a role in regulating the kinetics of signaling in the phototransduction cascade. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A single-cell transcriptomic analysis in a rat model of radiation-induced lung injury identified the RGS16 as an orthologous rat gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].