Basic Information

Symbol
RGS4
RNA class
mRNA
Alias
Regulator Of G Protein Signaling 4 Regulator Of G-Protein Signaling 4 Schizophrenia Disorder 9 SCZD9 RGP4 Regulator Of G-Protein Signalling 4
Location (GRCh38)
1:163068775-163076802
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005613.6
Sequence length
2984.0 nt
GC content
0.4068

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-832.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -890.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 757.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001102445.3 NCBI
ACUGCGUGGAGACGAUGAUCCUGCCAGCUCCCUUUUGGAAAUCGUGAGG… 3215 nt 0.4152
NM_001113380.1 NCBI
ACUUUCCCGAGGUGCUUCUACAGUUCCCUCUGCCAGCAGGGGAACAGAU… 3055 nt 0.4059
NM_001113381.1 NCBI
GCUGGAGAGGCAGAGGGAGACAGAGGAGCUGGUACUGCAGAGCGGUCGU… 2924 nt 0.4138
NM_005613.6 NCBI
AAGACGCUCAGAGGAUUCUGACAAUAUCUUUACCGGAGAAGAGGCAAAG… 2984 nt 0.4068
Summary

Regulator of G protein signaling (RGS) family members are regulatory molecules that act as GTPase activating proteins (GAPs) for G alpha subunits of heterotrimeric G proteins. RGS proteins are able to deactivate G protein subunits of the Gi alpha, Go alpha and Gq alpha subtypes. They drive G proteins into their inactive GDP-bound forms. Regulator of G protein signaling 4 belongs to this family. All RGS proteins share a conserved 120-amino acid sequence termed the RGS domain. Regulator of G protein signaling 4 protein is 37% identical to RGS1 and 97% identical to rat Rgs4. This protein negatively regulate signaling upstream or at the level of the heterotrimeric G protein and is localized in the cytoplasm. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the RGS4 transcript, a brain development protein, increased in abundance at 0.3 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].