Basic Information

Symbol
RIMS2
RNA class
mRNA
Alias
Regulating Synaptic Membrane Exocytosis 2 RIM2 KIAA0751 RAB3IP3 OBOE Regulating Synaptic Membrane Exocytosis Protein 2 Rab-3-Interacting Molecule 2 Rab-3-Interacting Protein 3 RAB3 Interacting Protein 3 Non-Small Cell Lung Cancer RimL3a Protein Non-Small Cell Lung Cancer RimL3c Protein Rab3-Interacting Molecule 2 Rab3-Interacting Protein Nuclear Protein CRSDS RIM 2
Location (GRCh38)
8:103500610-104254430
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001348484.3
Sequence length
7711.0 nt
GC content
0.4217

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2094.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2244.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2060.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001100117.3 NCBI
AGUUCCCCUUUCCCUUGAACCGCUCACUUCACAGCCCUUCGCCCCCGGG… 8601 nt 0.4188
NM_001282881.2 NCBI
ACACUUCAGCUGGGAAUGCCCAAAAAGCUUACUGCUGUUUAGAAUUCUU… 8129 nt 0.4031
NM_001282882.2 NCBI
ACUCCAGCAGCUCCAGCCUCCAGGAUUCUCAGCUCCCUCCCGGGCGAGA… 5450 nt 0.4099
NM_001348484.3 NCBI
AGUUCCCCUUUCCCUUGAACCGCUCACUUCACAGCCCUUCGCCCCCGGG… 7711 nt 0.4217
NM_001348485.2 NCBI
AGUUCCCCUUUCCCUUGAACCGCUCACUUCACAGCCCUUCGCCCCCGGG… 8373 nt 0.4165
NM_001348486.2 NCBI
AGUUCCCCUUUCCCUUGAACCGCUCACUUCACAGCCCUUCGCCCCCGGG… 8772 nt 0.4194
NM_001348487.2 NCBI
AGUUCCCCUUUCCCUUGAACCGCUCACUUCACAGCCCUUCGCCCCCGGG… 8631 nt 0.4191
NM_001348488.2 NCBI
AGUUCCCCUUUCCCUUGAACCGCUCACUUCACAGCCCUUCGCCCCCGGG… 8685 nt 0.4189
NM_001348489.2 NCBI
AGUUCCCCUUUCCCUUGAACCGCUCACUUCACAGCCCUUCGCCCCCGGG… 9201 nt 0.4214
NM_001348490.2 NCBI
AGUUCCCCUUUCCCUUGAACCGCUCACUUCACAGCCCUUCGCCCCCGGG… 9114 nt 0.4212
Showing 1 to 10 of 33 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a presynaptic protein that interacts with RAB3, a protein important for normal neurotransmitter release. The encoded protein can also bind several other synaptic proteins, including UNC-13 homolog B, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, and synaptotagmin 1. This protein is involved in synaptic membrane exocytosis. Polymorphisms in this gene have been associated with degenerative lumbar scoliosis. [provided by RefSeq, Feb 2017]

Forensic Context

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