Basic Information

Symbol
RNF121
RNA class
mRNA
Alias
Ring Finger Protein 121 E3 Ubiquitin Ligase RNF121 FLJ11099 RING Finger Protein 121 EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
11:71929018-71997597
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018320.5
Sequence length
2282.0 nt
GC content
0.5298

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-860.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -900.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 692.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001300926.2 NCBI
GGGGCGAGCCGUGAAGAUGGCGGCAGUGGUGGAGGUGGAGGUUGGAGGU… 2120 nt 0.5340
NM_018320.5 NCBI
GGGGCGAGCCGUGAAGAUGGCGGCAGUGGUGGAGGUGGAGGUUGGAGGU… 2282 nt 0.5298
Summary

The protein encoded by this gene contains a RING finger, a motif present in a variety of functionally distinct proteins and known to be involved in protein-protein and protein-DNA interactions. Several alternatively spliced transcript variants have been noted for this gene, however, not all are likely to encode viable protein products. [provided by RefSeq, Sep 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.