Basic Information

Symbol
RNF20
RNA class
mRNA
Alias
Ring Finger Protein 20 BRE1A HBRE1 BRE1 RING-Type E3 Ubiquitin Transferase BRE1A E3 Ubiquitin-Protein Ligase BRE1A FLJ20382 FLJ11189 KAIA2779 BRE1 E3 Ubiquitin Ligase Homolog (S. Cerevisiae) BRE1 E3 Ubiquitin Ligase Homolog Homolog Of S. Cerevisiae BRE1 RING Finger Protein 20 EC 2.3.2.27 EC 6.3.2 BRE1-A
Location (GRCh38)
9:101533853-101563344
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_019592.7
Sequence length
3938.0 nt
GC content
0.4533

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1165.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1242.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 874.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_019592.7 NCBI
AAGUUCUGCCUUGUCUCCGCCGCGGGUCAGGGGUGAGAGCUGGAAUCUC… 3938 nt 0.4533
Summary

The protein encoded by this gene shares similarity with BRE1 of S. cerevisiae. The protein encoded by this human gene is an E3 ubiquitin ligase that regulates chromosome structure by monoubiquitinating histone H2B. This protein acts as a putative tumor suppressor and positively regulates the p53 tumor suppressor as well as numerous histone H2A and H2B genes. In contrast, this protein also suppresses the expression of several protooncogenes and growth-related genes, including many genes that are induced by epidermal growth factor. This gene selectively suppresses the expression of some genes by interfering with chromatin recruitment of transcription elongation factor SII (TFIIS). [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

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