Basic Information

Symbol
ROBO1
RNA class
mRNA
Alias
Roundabout Guidance Receptor 1 DUTT1 SAX3 Deleted In U Twenty Twenty Roundabout Homolog 1 FLJ21882 Roundabout, Axon Guidance Receptor, Homolog 1 (Drosophila) Roundabout (Axon Guidance Receptor, Drosophila) Homolog 1 Roundabout, Axon Guidance Receptor, Homolog 1 H-Robo-1 CPHD8 NORS NYS8
Location (GRCh38)
3:78597239-79767998
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002941.4
Sequence length
6927.0 nt
GC content
0.4461

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1932.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2066.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1728.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145845.2 NCBI
AAUUGAGCUGGAGAGGAGGCAGCGUGAGAGCAGAAACUUCAGACGCCGC… 7328 nt 0.4730
NM_002941.4 NCBI
GCAUUAAUAGUAAUACAGAUAACGGGUUUGAAAGAAUUCUCUACUGAAG… 6927 nt 0.4461
NM_133631.4 NCBI
AAUUGAGCUGGAGAGGAGGCAGCGUGAGAGCAGAAACUUCAGACGCCGC… 7493 nt 0.4708
Summary

Bilateral symmetric nervous systems have special midline structures that establish a partition between the two mirror image halves. Some axons project toward and across the midline in response to long-range chemoattractants emanating from the midline. The product of this gene is a member of the immunoglobulin gene superfamily and encodes an integral membrane protein that functions in axon guidance and neuronal precursor cell migration. This receptor is activated by SLIT-family proteins, resulting in a repulsive effect on glioma cell guidance in the developing brain. A related gene is located at an adjacent region on chromosome 3. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ROBO1 mRNA transcript exhibited a 4-fold higher expression in CEU (European) populations compared to Asians in lymphoblastoid cell line studies, indicating its potential for population differentiation [Daca-Roszak & Zietkiewicz DOI:10.1007/s13353-019-00510-1]. In a separate investigation of peripheral blood from Chinese individuals, the ROBO1 was identified as a differentially expressed gene showing a steady decline in expression with advancing age and was linked to inflammaging, contributing to a robust age prediction model [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].