Basic Information

Symbol
ROBO2
RNA class
mRNA
Alias
Roundabout Guidance Receptor 2 KIAA1568 Roundabout Homolog 2 Roundabout, Axon Guidance Receptor, Homolog 2 (Drosophila) Roundabout (Axon Guidance Receptor, Drosophila) Homolog 2 Roundabout, Axon Guidance Receptor, Homolog 2 SAX3
Location (GRCh38)
3:75906695-77649964
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001395656.1
Sequence length
9018.0 nt
GC content
0.4210

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2501.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2674.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2186.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001128929.3 NCBI
AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… 8393 nt 0.4248
NM_001290039.2 NCBI
CGUAGGAGUUCGGAUUCUCCACCCGAAUCGUCCUGAUUUCCCUUCUCCU… 8745 nt 0.4182
NM_001290040.2 NCBI
CGUAGGAGUUCGGAUUCUCCACCCGAAUCGUCCUGAUUUCCCUUCUCCU… 8928 nt 0.4194
NM_001290065.2 NCBI
CGUAGGAGUUCGGAUUCUCCACCCGAAUCGUCCUGAUUUCCCUUCUCCU… 8872 nt 0.4161
NM_001378190.1 NCBI
AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… 8678 nt 0.4279
NM_001378191.1 NCBI
AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… 8804 nt 0.4287
NM_001378192.1 NCBI
AUUAGGAUCACACAGGCAGCCUGAAAGCUGUCAGUACAACUGCUUCUCA… 8808 nt 0.4189
NM_001378193.1 NCBI
CGUAGGAGUUCGGAUUCUCCACCCGAAUCGUCCUGAUUUCCCUUCUCCU… 9006 nt 0.4207
NM_001378194.1 NCBI
AUUAGGAUCACACAGGCAGCCUGAAAGCUGUCAGUACAACUGCUUCUCA… 8643 nt 0.4172
NM_001378195.1 NCBI
AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… 8531 nt 0.4260
Showing 1 to 10 of 24 entries
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the ROBO family, part of the immunoglobulin superfamily of proteins that are highly conserved from fly to human. The encoded protein is a transmembrane receptor for the slit homolog 2 protein and functions in axon guidance and cell migration. Mutations in this gene are associated with vesicoureteral reflux, characterized by the backward flow of urine from the bladder into the ureters or the kidney. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2014]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that acute ethanol exposure induces anxiolysis and increases the mRNA levels of the ROBO2 in the amygdala, a change validated by qPCR [Krishnan et al. DOI:10.1038/S41380-022-01732-2].