Basic Information

Symbol
ROBO2
RNA class
mRNA
Alias
Roundabout Guidance Receptor 2 KIAA1568 Roundabout Homolog 2 Roundabout, Axon Guidance Receptor, Homolog 2 (Drosophila) Roundabout (Axon Guidance Receptor, Drosophila) Homolog 2 Roundabout, Axon Guidance Receptor, Homolog 2 SAX3
Location (GRCh38)
3:75906695-77649964
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001395656.1
Sequence length
9018.0 nt
GC content
0.4210

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2501.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2674.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2186.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001378196.1 NCBI
AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… 8522 nt 0.4262
NM_001378197.1 NCBI
CGUAGGAGUUCGGAUUCUCCACCCGAAUCGUCCUGAUUUCCCUUCUCCU… 8859 nt 0.4188
NM_001378198.1 NCBI
AUUAGGAUCACACAGGCAGCCUGAAAGCUGUCAGUACAACUGCUUCUCA… 8535 nt 0.4159
NM_001378199.1 NCBI
AUUAGGAUCACACAGGCAGCCUGAAAGCUGUCAGUACAACUGCUUCUCA… 8526 nt 0.4161
NM_001378200.1 NCBI
AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… 8405 nt 0.4251
NM_001378201.1 NCBI
AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… 8396 nt 0.4253
NM_001378202.1 NCBI
CGUAGGAGUUCGGAUUCUCCACCCGAAUCGUCCUGAUUUCCCUUCUCCU… 8736 nt 0.4183
NM_001378203.1 NCBI
AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… 8222 nt 0.4234
NM_001394212.1 NCBI
AUUAGGAUCACACAGGCAGCCUGAAAGCUGUCAGUACAACUGCUUCUCA… 8922 nt 0.4195
NM_001394213.1 NCBI
AUUAGGAUCACACAGGCAGCCUGAAAGCUGUCAGUACAACUGCUUCUCA… 8661 nt 0.4169
Showing 11 to 20 of 24 entries
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the ROBO family, part of the immunoglobulin superfamily of proteins that are highly conserved from fly to human. The encoded protein is a transmembrane receptor for the slit homolog 2 protein and functions in axon guidance and cell migration. Mutations in this gene are associated with vesicoureteral reflux, characterized by the backward flow of urine from the bladder into the ureters or the kidney. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2014]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that acute ethanol exposure induces anxiolysis and increases the mRNA levels of the ROBO2 in the amygdala, a change validated by qPCR [Krishnan et al. DOI:10.1038/S41380-022-01732-2].