Basic Information

Symbol
ROCK2
RNA class
mRNA
Alias
Rho Associated Coiled-Coil Containing Protein Kinase 2 Rho-Associated, Coiled-Coil-Containing Protein Kinase II Rho-Associated Protein Kinase 2 P164 ROCK-2 EC 2.7.11.1 ROCK-II Rho-Associated, Coiled-Coil-Containing Protein Kinase 2 Rho Kinase 2 EC 2.7.11 KIAA0619
Location (GRCh38)
2:11179759-11348330
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004850.5
Sequence length
8345.0 nt
GC content
0.4008

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2263.47 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2424.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1815.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001321643.2 NCBI
GCGCCCUGGGCGGAUCUAAGCGAUGGCACCGGCCGCCGAGAGGGCAGGA… 7868 nt 0.3752
NM_004850.5 NCBI
AGACGGGCGGCCGCGCGGGAGUGUGUGCGCCGGGAGCUGGCUGAGGGAC… 8345 nt 0.4008
Summary

The protein encoded by this gene is a serine/threonine kinase that regulates cytokinesis, smooth muscle contraction, the formation of actin stress fibers and focal adhesions, and the activation of the c-fos serum response element. This protein, which is an isozyme of ROCK1 is a target for the small GTPase Rho. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human postmortem prefrontal cortex demonstrated that the ROCK2 was identified as a high-confidence gene common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159]. A study in humans identified the ROCK2 as a candidate mRNA marker for blood deposition time estimation, demonstrating statistically significant rhythmic expression with a peak between 01:00 h and 03:00 h [Lech et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2015.12.008].