Basic Information

Symbol
RPL10
RNA class
mRNA
Alias
Ribosomal Protein L10 DXS648E QM DXS648 UL16 NOV L10 Large Ribosomal Subunit Protein UL16 60S Ribosomal Protein L10 Laminin Receptor Homolog Tumor Suppressor QM FLJ23544 Wilms Tumor-Related Protein Protein QM AUTSX5 MRXS35
Location (GRCh38)
X:154389955-154409168
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006013.5
Sequence length
2164.0 nt
GC content
0.5152

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-803.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -840.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 430.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256577.2 NCBI
AAAUAUACGUCUGUCACAGUUAACGGCAAAGCCUAGGGCAAGAGUUCUA… 2337 nt 0.5208
NM_001256580.2 NCBI
AAAUAUACGUCUGUCACAGUUAACGGCAAAGCCUAGGGCAAGAGUUCUA… 2392 nt 0.5263
NM_001303624.2 NCBI
CUCUUUCCCUUCGGUGUGGUGAGUAAGCGCAGUUGUCGUCUCUUGCGGU… 2266 nt 0.5154
NM_001303625.1 NCBI
AAAUAUACGUCUGUCACAGUUAACGGCAAAGCCUAGGGCAAGAGUUCUA… 2504 nt 0.5244
NM_001303626.1 NCBI
CCACUGAAGAUCCUGGUGUCGCCAUGGGCCGCCGCCCCGCCCGUUGUUA… 2159 nt 0.5104
NM_006013.5 NCBI
CUCUUUCCCUUCGGUGUGCCACUGAAGAUCCUGGUGUCGCCAUGGGCCG… 2164 nt 0.5152
Summary

This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 60S ribosome subunit. The related protein in chicken can bind to c-Jun and can repress c-Jun-mediated transcriptional activation. Some studies have detected an association between variation in this gene and autism spectrum disorders, though others do not detect this relationship. There are multiple pseudogenes of this gene dispersed throughout the genome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2015]

Forensic Context

A study in humans identified the RPL10 as a previously reported mRNA associated with age in blood [Dørum et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102976].