Basic Information

Symbol
RPL32
RNA class
mRNA
Alias
Ribosomal Protein L32 EL32 L32 Large Ribosomal Subunit Protein EL32 60S Ribosomal Protein L32 PP9932
Location (GRCh38)
3:12834485-12841582
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000994.4
Sequence length
2094.0 nt
GC content
0.4642

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-637.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -681.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 444.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000994.4 NCBI
AGCCCUUGCGCGCCACCGUCCCUUCUCUCUUCCUCGGCGCUGCCUACGG… 2094 nt 0.4642
NM_001007073.1 NCBI
AGGGGUUACGACCCAUCAGCCCUUGCGCGCCACCGUCCCUUCUCUCUUC… 1767 nt 0.4759
NM_001007074.1 NCBI
GACCUCCUGGGAUCGCAUCUGGAGAGUGCCUAGUAUUCUGCCAGCUUCG… 1787 nt 0.4734
Summary

Ribosomes, the organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 60S subunit. The protein belongs to the L32E family of ribosomal proteins. It is located in the cytoplasm. Although some studies have mapped this gene to 3q13.3-q21, it is believed to map to 3p25-p24. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the RPL32 (RPL32) was one of the most stably expressed reference genes in contused skeletal muscle, with a stability value of 0.2417 in NormFinder and an M value of 1.360 in geNorm [Sun et al. DOI:10.1007/s00414-011-0604-3]. Subsequent research in rats confirmed the RPL32 as a stably expressed reference gene for normalizing the expression of wound-healing mRNAs, where its stable expression underpins the calculation of informative gene expression ratios that enhance the performance of predictive models for wound age estimation [Li et al. DOI:10.1007/s00414-023-03095-x].