Basic Information

Symbol
RPTN
RNA class
mRNA
Alias
Repetin FLJ39117 Intermediate Filament-Associated Protein
Location (GRCh38)
1:152153595-152159228
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001122965.1
Sequence length
3569.0 nt
GC content
0.4632

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-914.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -980.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 709.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001122965.1 NCBI
AUCCUCUCUGACUCCUGAAUCUUCUGCUCCUUCCUCCUCAAGCAGGUUC… 3569 nt 0.4632
Summary

Predicted to enable calcium ion binding activity and transition metal ion binding activity. Predicted to be located in cytosol. Predicted to be active in cornified envelope. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.