Basic Information

Symbol
RSPH1
RNA class
mRNA
Alias
Radial Spoke Head Component 1 Meichroacidin RSPH10A RSP44 TSGA2 Male Meiotic Metaphase Chromosome-Associated Acidic Protein Radial Spoke Head 1 Homolog Cancer/Testis Antigen 79 FLJ32753 CILD24 CT79 TSA2 Radial Spoke Head 1 Homolog (Chlamydomonas) Testis Specific A2 Homolog (Mouse) Testes Specific Gene A2 Homolog Testis-Specific Gene A2 Protein Testis Specific A2 Homolog
Location (GRCh38)
21:42472486-42496366
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_080860.4
Sequence length
1300.0 nt
GC content
0.4962

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-397.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -416.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 251.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286506.2 NCBI
AGAGGCGCUGCGGCUGUGAUCCAGGCUGGGGCGAGACCAUGUCGGACCU… 1186 nt 0.4865
NM_080860.4 NCBI
AGAGGCGCUGCGGCUGUGAUCCAGGCUGGGGCGAGACCAUGUCGGACCU… 1300 nt 0.4962
Summary

This gene encodes a male meiotic metaphase chromosome-associated acidic protein. This gene is expressed in tissues with motile cilia or flagella, including the trachea, lungs, airway brushings, and testes. Mutations in this gene result in primary ciliary dyskinesia-24. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that γ-ray exposure induced up-regulation of the RSPH1 in liver tissue, as identified through oligonucleotide microarray analysis of 6,050 genes [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].