Basic Information

Symbol
RSRC1
RNA class
mRNA
Alias
Arginine And Serine Rich Coiled-Coil 1 SRrp53 BM-011 SFRS21 Arginine/Serine-Rich Coiled-Coil Protein 1 Splicing Factor, Arginine/Serine-Rich 21 Arginine/Serine-Rich Coiled-Coil 1 Serine/Arginine-Related Protein 53 MGC12197 SRRP53 MRT70
Location (GRCh38)
3:158105675-158545734
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001271838.2
Sequence length
2597.0 nt
GC content
0.3889

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-633.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -682.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 761.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001271834.2 NCBI
AGAACCAGGAAGGCGCUGAGCUUAAACUGAAGCAAGUUCGGUGGACGCC… 2397 nt 0.3805
NM_001271838.2 NCBI
AGAACCAGGAAGGCGCUGAGCUUAAACUGAAGCAAGUUCGGUGGACGCC… 2597 nt 0.3889
NM_016625.4 NCBI
AGAACCAGGAAGGCGCUGAGCUUAAACUGAAGCAAGUUCGGUGGACGCC… 2585 nt 0.3876
Summary

This gene encodes a member of the serine and arginine rich-related protein family. The encoded protein is involved in both constitutive and alternative mRNA splicing. This gene may be associated with schizophrenia. A pseudogene of this gene is located on chromosome 9. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Nov 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.