Basic Information

Symbol
ATR
RNA class
mRNA
Alias
ATR Checkpoint Kinase FRP1 SCKL1 SCKL MEC1 Ataxia Telangiectasia And Rad3-Related Protein Serine/Threonine-Protein Kinase ATR ATR Serine/Threonine Kinase EC 2.7.11.1 MEC1, Mitosis Entry Checkpoint 1, Homolog (S. Cerevisiae) MEC1, Mitosis Entry Checkpoint 1, Homolog Ataxia Telangiectasia And Rad3 Related FRAP-Related Protein-1 FRAP-Related Protein 1 FCTCS
Location (GRCh38)
3:142449007-142578781
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001184.4
Sequence length
8158.0 nt
GC content
0.3968

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2174.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2338.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2193.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001184.4 NCBI
GUGGUUGACUAGUGCCUCGCAGCCUCAGCAUGGGGGAACAUGGCCUGGA… 8158 nt 0.3968
NM_001354579.2 NCBI
GUGGUUGACUAGUGCCUCGCAGCCUCAGCAUGGGGGAACAUGGCCUGGA… 7966 nt 0.3972
Summary

The protein encoded by this gene is a serine/threonine kinase and DNA damage sensor, activating cell cycle checkpoint signaling upon DNA stress. The encoded protein can phosphorylate and activate several proteins involved in the inhibition of DNA replication and mitosis, and can promote DNA repair, recombination, and apoptosis. This protein is also important for fragile site stability and centrosome duplication. Defects in this gene are a cause of Seckel syndrome 1. [provided by RefSeq, Aug 2017] CIViC Summary for ATR Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.