Basic Information

Symbol
ATRN
RNA class
mRNA
Alias
Attractin DPPT-L MGCA Mahogany Protein Mahogany Homolog Attractin-2 KIAA0548
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_139321.3
Sequence length
8651.0 nt
GC content
0.4753

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2833.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2994.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2244.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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ACAGCCCCGCCCCGCACGGCCAGGCGAAGCGGAGCCGGCCGUGCGGUGU… 4122 nt 0.4966
Summary

This gene encodes both membrane-bound and secreted protein isoforms. A membrane-bound isoform exhibits sequence similarity with the mouse mahogany protein, a receptor involved in controlling obesity. A secreted isoform is involved in the initial immune cell clustering during inflammatory responses that may regulate the chemotactic activity of chemokines. [provided by RefSeq, Apr 2016]

Forensic Context

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