Basic Information

Symbol
ATRNL1
RNA class
mRNA
Alias
Attractin Like 1 KIAA0534 ALP Attractin-Like Protein 1 FLJ45344 Attractin-Like 1 BA338L11.1 BA454H24.1
Location (GRCh38)
10:115093365-115948999
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_207303.4
Sequence length
8746.0 nt
GC content
0.4051

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2484.48 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2646.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2472.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001276282.4 NCBI
AGUUGGCGCGGGCCGCGGGCGAGGCGGGGCCGCGCGCGGGGUCCCCUCC… 1811 nt 0.5052
NM_207303.4 NCBI
AGUUGGCGCGGGCCGCGGGCGAGGCGGGGCCGCGCGCGGGGUCCCCUCC… 8746 nt 0.4051
Summary

Predicted to enable Notch binding activity. Predicted to act upstream of or within G protein-coupled receptor signaling pathway. Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.