Basic Information

Symbol
SAFB2
RNA class
mRNA
Alias
Scaffold Attachment Factor B2 KIAA0138 SAF-B2
Location (GRCh38)
19:5586981-5624046
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014649.3
Sequence length
3167.0 nt
GC content
0.5696

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1147.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1198.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 870.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014649.3 NCBI
AGAGCCGCUAUAGCUGCCGGCGGUGUGCGACUGAGUCGGUGGCGAAGAC… 3167 nt 0.5696
Summary

The protein encoded by this gene, along with its paralog (scaffold attachment factor B1), is a repressor of estrogen receptor alpha. The encoded protein binds scaffold/matrix attachment region (S/MAR) DNA and is involved in cell cycle regulation, apoptosis, differentiation, the stress response, and regulation of immune genes. [provided by RefSeq, May 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.