Basic Information

Symbol
SALL4
RNA class
mRNA
Alias
Spalt Like Transcription Factor 4 ZNF797 Zinc Finger Protein SALL4 Zinc Finger Protein 797 Sal-Like Protein 4 DJ1112F19.1 Sal (Drosophila)-Like 4 Sal-Like 4 (Drosophila) HSAL4 DRRS IVIC
Location (GRCh38)
20:51782331-51802521
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020436.5
Sequence length
5209.0 nt
GC content
0.5126

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1778.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1876.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1292.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318031.2 NCBI
AAUUACUGGGACAUGCGCGUUCCGGCCGAAGGGGGGUAAAUUUCCCAAC… 3898 nt 0.4974
NM_020436.5 NCBI
AAUUACUGGGACAUGCGCGUUCCGGCCGAAGGGGGGUAAAUUUCCCAAC… 5209 nt 0.5126
Summary

This gene encodes a zinc finger transcription factor thought to play a role in the development of abducens motor neurons. Defects in this gene are a cause of Duane-radial ray syndrome (DRRS). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

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