Basic Information

Symbol
SAMD5
RNA class
mRNA
Alias
Sterile Alpha Motif Domain Containing 5 DJ875H10.1 Sterile Alpha Motif Domain-Containing Protein 5 SAM Domain-Containing Protein 5 SAM Domain Containing 1 SAMDC1
Location (GRCh38)
6:147508690-147737547
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001030060.3
Sequence length
6326.0 nt
GC content
0.3990

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2027.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2137.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1545.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001030060.3 NCBI
AGUGCCUGCGAGCUCCGCUGCUGCUUGGGGAAUUCACUUUGCUGCUUGU… 6326 nt 0.3990
Summary

Predicted to be involved in regulation of intracellular signal transduction. Located in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the SAMD5 was an overlapping differentially expressed gene from a microarray study, located on proximal chromosome 10 and overexpressed in the methamphetamine high drinking (MAHDR) line compared to the low drinking line [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].