Basic Information

Symbol
ATXN1L
RNA class
mRNA
Alias
Ataxin 1 Like BOAT1 Brother Of Ataxin-1 Brother Of ATXN1 Ataxin-1-Like BOAT Brother Of Ataxin 1 Ataxin 1-Like
Location (GRCh38)
16:71808439-71885268
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001137675.4
Sequence length
7896.0 nt
GC content
0.5079

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2783.54 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2935.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1790.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001137675.4 NCBI
AUCUCCGGGCGCCCGGCUGUGGGGGGCGCUGGGUGUGGGGCGGCUCCGG… 7896 nt 0.5079
Summary

Predicted to enable RNA binding activity and chromatin binding activity. Predicted to be involved in several processes, including learning or memory; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; and social behavior. Predicted to act upstream of or within extracellular matrix organization; lung alveolus development; and positive regulation of hematopoietic stem cell proliferation. Located in nucleolus and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025] CIViC Summary for ATXN1L Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.