Basic Information

Symbol
SBSN
RNA class
mRNA
Alias
Suprabasin HLAR698 UNQ698
Location (GRCh38)
19:35523367-35528351
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001166034.2
Sequence length
1946.0 nt
GC content
0.5971

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-772.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -803.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 566.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001166034.2 NCBI
CUCUGCAUCCUUCCCGACCUUCCCAGCAAUAUGCAUCUUGCACGUCUGG… 1946 nt 0.5971
NM_001166035.2 NCBI
CUCUGCAUCCUUCCCGACCUUCCCAGCAAUAUGCAUCUUGCACGUCUGG… 683 nt 0.5666
NM_198538.4 NCBI
CUCUGCAUCCUUCCCGACCUUCCCAGCAAUAUGCAUCUUGCACGUCUGG… 917 nt 0.5736
Summary

Located in extracellular exosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

The literature review notes that the SBSN is a protein marker found in vaginal fluid for body fluid identification [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].